More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0260 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  100 
 
 		 438 aa  904    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  72.6 
 
 		 438 aa  646    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  71.98 
 
 		 439 aa  650    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  73.06 
 
 		 437 aa  665    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  72.83 
 
 		 438 aa  662    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  72.83 
 
 		 438 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  77.63 
 
 		 439 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  48.62 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  49.31 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  46.1 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  46.9 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  47.48 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  46.47 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  44.55 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  49.38 
 
 		 428 aa  362  6e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  42.63 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  44.72 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  43.25 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  45.18 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  43.25 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  43.12 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  42.56 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  42.56 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  42.56 
 
 		 429 aa  342  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  41.39 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  41.88 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  41.5 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  41.71 
 
 		 426 aa  339  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  41.88 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  41.88 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  41.01 
 
 		 425 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  42.33 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  42.17 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  41.71 
 
 		 427 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  42.33 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  41.82 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  42.33 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  42.33 
 
 		 427 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  42.33 
 
 		 427 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  40 
 
 		 448 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  43.41 
 
 		 428 aa  328  9e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  40.96 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  40.55 
 
 		 426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  41.47 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  40.32 
 
 		 426 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  40.96 
 
 		 427 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  40.55 
 
 		 427 aa  321  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  42.11 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  39.86 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  41.88 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  41.03 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  41.24 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  41.24 
 
 		 428 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  41.38 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  41.38 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  41.38 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  41.38 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  41.38 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  40 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  39.22 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  39.63 
 
 		 428 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  38.23 
 
 		 463 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  38.23 
 
 		 463 aa  299  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  39.63 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  41.11 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  37.85 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  37.66 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  37.28 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  37.15 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  36.48 
 
 		 465 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  37.5 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  35.62 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  36.56 
 
 		 465 aa  286  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  34.97 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  35.76 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  36.85 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  35.12 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.98 
 
 		 469 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  35.7 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  37.7 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  38 
 
 		 470 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  39.32 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  38 
 
 		 470 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  39.32 
 
 		 433 aa  279  8e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  36.64 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.97 
 
 		 469 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  34.12 
 
 		 469 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  34.33 
 
 		 469 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  33.91 
 
 		 469 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  34.33 
 
 		 469 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  37.3 
 
 		 460 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  34.33 
 
 		 469 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  34.05 
 
 		 469 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>