More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0075 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  100 
 
 		 434 aa  880    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  58.29 
 
 		 435 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  58.56 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  53.56 
 
 		 439 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  54.04 
 
 		 453 aa  480  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  49.65 
 
 		 435 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  49.42 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  50.69 
 
 		 435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  49.31 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  49.77 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  48.62 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  47.69 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  45.73 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  47.93 
 
 		 439 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  48.05 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  47.59 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  43.57 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  47.94 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  44.24 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  48.05 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  47.71 
 
 		 425 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  46.9 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  42.92 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  44.29 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  45.66 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  45.89 
 
 		 428 aa  359  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  45.06 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  45.06 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  43.19 
 
 		 428 aa  355  7.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  44.21 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  44.6 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  44.83 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  43.58 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  44.83 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  43.75 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  43.5 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  42.36 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  42.82 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  42.82 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  42.82 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  44.22 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  44.19 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  44.6 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  43.08 
 
 		 427 aa  345  8e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  44.04 
 
 		 427 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  44.37 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  44.6 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  44.14 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  44.14 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  44.14 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  42.49 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  42.82 
 
 		 428 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  42.49 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  42.82 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  42.49 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  42.49 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  42.26 
 
 		 428 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  43.54 
 
 		 426 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  42.73 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  43.42 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  36.52 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.71 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.92 
 
 		 469 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  36.23 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  35.14 
 
 		 469 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  34.49 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  37.96 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  34.77 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  34.49 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  34.27 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  36.58 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  34.49 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  35.87 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  35.87 
 
 		 463 aa  299  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  37.8 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  37.31 
 
 		 461 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  35.64 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  35.22 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  33.84 
 
 		 469 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  38.98 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  35.51 
 
 		 461 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  33.62 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  35.08 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  33.84 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  33.84 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  35.57 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  34.86 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  34.86 
 
 		 461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  34.78 
 
 		 470 aa  286  4e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  34.57 
 
 		 474 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  37.45 
 
 		 460 aa  285  8e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  36.52 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  37.88 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>