More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2573 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  100 
 
 
429 aa  875    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  64.42 
 
 
453 aa  561  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  58.56 
 
 
434 aa  508  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  58.06 
 
 
435 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  52.2 
 
 
435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  54.04 
 
 
439 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  48.73 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  46.9 
 
 
438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  46.22 
 
 
439 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  48.74 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  46.67 
 
 
438 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  47.7 
 
 
438 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  47 
 
 
437 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  45.16 
 
 
438 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  47.86 
 
 
425 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  45.39 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  46.57 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  44.55 
 
 
427 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  43.55 
 
 
426 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  46.19 
 
 
428 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  44.29 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  43.85 
 
 
427 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  43.85 
 
 
427 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  43.85 
 
 
427 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  45.59 
 
 
426 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  46.78 
 
 
428 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  46.68 
 
 
428 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  46.78 
 
 
428 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  46.78 
 
 
428 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  46.78 
 
 
428 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  46.78 
 
 
428 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  43.39 
 
 
427 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  43.16 
 
 
427 aa  349  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  43.85 
 
 
429 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  46.44 
 
 
428 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  46.44 
 
 
428 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  46.04 
 
 
426 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  43.16 
 
 
427 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  46.04 
 
 
429 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  46.04 
 
 
429 aa  347  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  41.83 
 
 
448 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  46.44 
 
 
428 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  46.44 
 
 
428 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  46.44 
 
 
428 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  46.44 
 
 
428 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  46.44 
 
 
428 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  46.44 
 
 
428 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  42.92 
 
 
427 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  44.14 
 
 
427 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  42.23 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  45.1 
 
 
426 aa  343  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  44.55 
 
 
429 aa  342  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  44.77 
 
 
434 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  43.39 
 
 
427 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  44.31 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  42.92 
 
 
427 aa  336  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  42 
 
 
426 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  42.46 
 
 
426 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  42.86 
 
 
428 aa  335  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  41.89 
 
 
447 aa  331  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  43.35 
 
 
428 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  42.93 
 
 
426 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  45.68 
 
 
429 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  41.11 
 
 
436 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  44.69 
 
 
429 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  41.65 
 
 
432 aa  318  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  41.67 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  38.64 
 
 
460 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  35.79 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  36.8 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  37.08 
 
 
468 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  36.52 
 
 
474 aa  282  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  36.72 
 
 
465 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  36.63 
 
 
463 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  36.63 
 
 
463 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  36.75 
 
 
473 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  36.55 
 
 
465 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  35.49 
 
 
470 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  41.53 
 
 
433 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  35.88 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  35.14 
 
 
469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  36.04 
 
 
467 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  35.04 
 
 
470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  41.05 
 
 
433 aa  272  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  35.85 
 
 
470 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  35.44 
 
 
465 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  34.49 
 
 
469 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  34.71 
 
 
469 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  36.77 
 
 
461 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  36.61 
 
 
461 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  34.49 
 
 
469 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  36.55 
 
 
461 aa  269  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  34.27 
 
 
469 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  39.9 
 
 
434 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  36.96 
 
 
460 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  35.79 
 
 
461 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  34.2 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  33.84 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  34.27 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  37.05 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.182156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>