283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1892 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  73.97 
 
 		 461 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  100 
 
 		 460 aa  954    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  75.65 
 
 		 461 aa  721    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  71.96 
 
 		 458 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  69.08 
 
 		 460 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  72.17 
 
 		 458 aa  682    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  68.12 
 
 		 461 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  63.42 
 
 		 463 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  58.15 
 
 		 459 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  51.95 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  49.03 
 
 		 465 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  49.46 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  47.84 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  48.83 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  49.36 
 
 		 470 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  47.94 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  47.2 
 
 		 469 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  49.03 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  47.84 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  48.51 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  47.51 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  48.6 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  47.64 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  46.98 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  48.7 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  48.06 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  47.73 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  46.97 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  46 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  48.61 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  48.26 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  44.49 
 
 		 468 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  48.04 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  47.53 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  45.69 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  48.03 
 
 		 465 aa  428  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  45.91 
 
 		 469 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  45.47 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  46.35 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  46.12 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  45.91 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  47.44 
 
 		 477 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  46.28 
 
 		 476 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  45.69 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  47.29 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  47.88 
 
 		 475 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  47.97 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  48.17 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  46.64 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  47.03 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  46.84 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  46.93 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  46.93 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  46.44 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  47.03 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  45.81 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  45.06 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  47.2 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  46.4 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  44.8 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  44.64 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  44.85 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  44.85 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  44.68 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  46.1 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  46.32 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  46.33 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  46.72 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  45.4 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  46.38 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  45.69 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  44.52 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  45.42 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  44.83 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  45.42 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  45.42 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  45.11 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  45.42 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  45.62 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  46.28 
 
 		 475 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  44.83 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  45.32 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  45.88 
 
 		 487 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  45.42 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  45.42 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  44.91 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  44.7 
 
 		 516 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  45.08 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  44.98 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  45.21 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  44.49 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  44.44 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  44.18 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  44.78 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  44.21 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  44.81 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  44.79 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  45.73 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  45.42 
 
 		 473 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  44.59 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>