253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0459 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  100 
 
 
459 aa  942    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  59.03 
 
 
460 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  59.43 
 
 
460 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  60.22 
 
 
458 aa  549  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  59.27 
 
 
461 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  59.61 
 
 
461 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  59.78 
 
 
458 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  59.52 
 
 
461 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  55.22 
 
 
463 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  55.94 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  54.64 
 
 
469 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  54.43 
 
 
469 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  54.86 
 
 
469 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  54.43 
 
 
469 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  54.43 
 
 
465 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  54.64 
 
 
469 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  54.43 
 
 
469 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  54.64 
 
 
469 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  54.43 
 
 
469 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  53.68 
 
 
467 aa  475  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  55.11 
 
 
469 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  52.79 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  53.36 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  52.46 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  52.58 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  52.36 
 
 
470 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  52.83 
 
 
461 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  52.39 
 
 
461 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  50.66 
 
 
474 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  52.61 
 
 
471 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  52.61 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  52.61 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  50.97 
 
 
463 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  52.49 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  52.16 
 
 
504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  49.46 
 
 
460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  49.57 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  50.67 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  52.17 
 
 
466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  51.94 
 
 
468 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  49.04 
 
 
473 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  51.5 
 
 
470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  51.71 
 
 
463 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  49.78 
 
 
470 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  51.71 
 
 
463 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  51.64 
 
 
470 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  49.46 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  52.16 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  49.68 
 
 
466 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  49.68 
 
 
471 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  49.78 
 
 
465 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  50.33 
 
 
462 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  48.92 
 
 
463 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  46.15 
 
 
511 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  48.08 
 
 
473 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  46.74 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  47.66 
 
 
473 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  48.5 
 
 
473 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  47.84 
 
 
465 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  47.64 
 
 
470 aa  415  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  49.14 
 
 
477 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  47.6 
 
 
481 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  48.79 
 
 
472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  49.76 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  47.62 
 
 
465 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  47.79 
 
 
472 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  46.01 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  47.03 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  48.37 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  47.35 
 
 
471 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  47.91 
 
 
475 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  47.71 
 
 
472 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  47.15 
 
 
476 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  46.38 
 
 
481 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  48.77 
 
 
472 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  46.17 
 
 
481 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  49.21 
 
 
471 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  47.15 
 
 
476 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  48.63 
 
 
475 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  46.22 
 
 
481 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  46.27 
 
 
453 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  46.6 
 
 
475 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  47.28 
 
 
472 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  46.96 
 
 
475 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  46.62 
 
 
476 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  43.95 
 
 
517 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  44.42 
 
 
480 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  46 
 
 
487 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  46.43 
 
 
483 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  45.36 
 
 
480 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  45.38 
 
 
475 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  45.38 
 
 
475 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  45.8 
 
 
483 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  46.19 
 
 
481 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  45.59 
 
 
483 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  45.59 
 
 
483 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  45.59 
 
 
483 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  45.28 
 
 
483 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  45.38 
 
 
483 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  44.33 
 
 
516 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>