259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0859 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  100 
 
 
460 aa  943    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  51.84 
 
 
469 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  50.32 
 
 
469 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  50.32 
 
 
469 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  49.56 
 
 
465 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  51.62 
 
 
465 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  50.32 
 
 
469 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  50.11 
 
 
469 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  50.11 
 
 
469 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  49.89 
 
 
469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  49.56 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  49.68 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  49.57 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  49.89 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  49.46 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  48.05 
 
 
466 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  49.67 
 
 
461 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  49.89 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  49.56 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  49.45 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  48.7 
 
 
462 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  49.45 
 
 
461 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  49.15 
 
 
473 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  49.24 
 
 
471 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  48.7 
 
 
465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  47.2 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  50.65 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  47.41 
 
 
470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  49.02 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  47.41 
 
 
470 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  48.21 
 
 
470 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  46.41 
 
 
462 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  47.52 
 
 
471 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  48.8 
 
 
466 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  46.54 
 
 
470 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  48.37 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  48.37 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  47.94 
 
 
468 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  49.46 
 
 
459 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  48.47 
 
 
461 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  47.8 
 
 
463 aa  438  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  47.77 
 
 
471 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  50.34 
 
 
460 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  47.95 
 
 
461 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  48.06 
 
 
463 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  46.42 
 
 
465 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  45.89 
 
 
473 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  46.64 
 
 
460 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  48.65 
 
 
467 aa  421  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  45.04 
 
 
471 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.32 
 
 
461 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  44.52 
 
 
472 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  44.08 
 
 
472 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  44.08 
 
 
472 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  45.99 
 
 
463 aa  411  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  46.87 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  43.83 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  43.95 
 
 
471 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  44.84 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  46.2 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  44.2 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  44.72 
 
 
472 aa  396  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  45.77 
 
 
458 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  43.04 
 
 
465 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  42.62 
 
 
477 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  41.4 
 
 
511 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  42.07 
 
 
475 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  42.07 
 
 
475 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  43.7 
 
 
476 aa  359  6e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  45.1 
 
 
473 aa  355  1e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  41.16 
 
 
504 aa  355  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  45.24 
 
 
473 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  39.17 
 
 
480 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  40.51 
 
 
470 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  41.56 
 
 
475 aa  345  8.999999999999999e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  41.1 
 
 
476 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  41.1 
 
 
476 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  40.34 
 
 
480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  41.8 
 
 
487 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  41.52 
 
 
517 aa  341  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  40.42 
 
 
482 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  40.69 
 
 
472 aa  341  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  40.08 
 
 
483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1381  threonine synthase  41.86 
 
 
499 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  39.79 
 
 
483 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  40.12 
 
 
481 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  39.83 
 
 
483 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  39.63 
 
 
483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  39.83 
 
 
483 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  39.83 
 
 
483 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  39.83 
 
 
483 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  39.83 
 
 
483 aa  339  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  39.83 
 
 
482 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  39.42 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  39.71 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  39.71 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  40.56 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  40.35 
 
 
547 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  39.29 
 
 
480 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  39.54 
 
 
481 aa  333  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>