245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1913 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  68.58 
 
 		 483 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  78.53 
 
 		 476 aa  791    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  68.58 
 
 		 483 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  66.94 
 
 		 483 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  68.58 
 
 		 483 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  67.35 
 
 		 483 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  100 
 
 		 475 aa  989    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  79.5 
 
 		 476 aa  783    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  67.35 
 
 		 483 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  67.76 
 
 		 483 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  67.35 
 
 		 483 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  79.75 
 
 		 475 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  79.75 
 
 		 471 aa  790    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  68.38 
 
 		 483 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  74.27 
 
 		 472 aa  717    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  68.38 
 
 		 483 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  81.43 
 
 		 481 aa  814    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  80.75 
 
 		 475 aa  797    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  78.53 
 
 		 476 aa  791    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  68.58 
 
 		 483 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  75.67 
 
 		 516 aa  770    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  74.32 
 
 		 470 aa  727    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  68.58 
 
 		 483 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  67.15 
 
 		 483 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  66.74 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  66.67 
 
 		 481 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  67.15 
 
 		 483 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  67.15 
 
 		 483 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  66.94 
 
 		 482 aa  631  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  67.15 
 
 		 483 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  66.12 
 
 		 483 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  64.46 
 
 		 480 aa  621  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  65.43 
 
 		 481 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  64.45 
 
 		 475 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  64.63 
 
 		 477 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  65.28 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  65.28 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  65.02 
 
 		 481 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  64.63 
 
 		 487 aa  615  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  64.67 
 
 		 480 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  64.81 
 
 		 481 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  61.81 
 
 		 480 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  59.45 
 
 		 473 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  58.11 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  57.84 
 
 		 476 aa  544  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  48.51 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  47.88 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  47.88 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  46.81 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  46.11 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  44.42 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  46.96 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  45.45 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  45.44 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  42.32 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  43.28 
 
 		 469 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  42.41 
 
 		 463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  42.41 
 
 		 463 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  42.65 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  42.86 
 
 		 469 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  44.63 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  44.42 
 
 		 461 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  42.35 
 
 		 469 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  43.37 
 
 		 463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  44.63 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  42.02 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  41.93 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  41.6 
 
 		 469 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  40.63 
 
 		 465 aa  349  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  41.72 
 
 		 469 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  41.6 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  40.63 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  42.77 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  42.98 
 
 		 466 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  40.8 
 
 		 465 aa  345  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  41.93 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  40 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  41.63 
 
 		 467 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  43.13 
 
 		 462 aa  342  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  39.75 
 
 		 504 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  42.86 
 
 		 463 aa  338  8e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  40.46 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  39.79 
 
 		 465 aa  336  5.999999999999999e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  40.17 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  41.23 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  40.66 
 
 		 461 aa  332  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  41.21 
 
 		 470 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  40.12 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  41.18 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  40.79 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  40.13 
 
 		 460 aa  330  4e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  40.59 
 
 		 470 aa  329  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  40.75 
 
 		 470 aa  328  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  40.55 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  40.6 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  40.13 
 
 		 472 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  40.46 
 
 		 465 aa  326  6e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  40.13 
 
 		 472 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  39.33 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  40.88 
 
 		 471 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>