265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6226 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  94.2 
 
 
483 aa  942    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  77.39 
 
 
481 aa  765    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  77.59 
 
 
481 aa  763    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  70.21 
 
 
480 aa  707    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  91.3 
 
 
483 aa  919    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  70.23 
 
 
487 aa  683    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  68.34 
 
 
475 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  76.6 
 
 
482 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  91.3 
 
 
483 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  91.3 
 
 
483 aa  919    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  96.69 
 
 
483 aa  967    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  68.12 
 
 
472 aa  641    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  67.08 
 
 
476 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  91.1 
 
 
483 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  69.38 
 
 
480 aa  694    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  91.3 
 
 
483 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  91.51 
 
 
483 aa  914    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  70.06 
 
 
475 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  70.06 
 
 
475 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  68.26 
 
 
476 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  85.3 
 
 
483 aa  869    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  99.79 
 
 
483 aa  995    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  76.35 
 
 
481 aa  769    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  100 
 
 
483 aa  997    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  88.15 
 
 
482 aa  887    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  98.34 
 
 
483 aa  981    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  77.18 
 
 
481 aa  759    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  97.72 
 
 
483 aa  972    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  86.75 
 
 
483 aa  877    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  100 
 
 
483 aa  997    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  67.76 
 
 
475 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  91.3 
 
 
483 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  68.26 
 
 
475 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  67.08 
 
 
476 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  91.3 
 
 
483 aa  919    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  69.87 
 
 
470 aa  658    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  65.77 
 
 
477 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  67.15 
 
 
475 aa  633  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  66.74 
 
 
481 aa  633  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  66.87 
 
 
471 aa  628  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  65.16 
 
 
480 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  63.07 
 
 
516 aa  600  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  55.62 
 
 
473 aa  536  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  55.23 
 
 
473 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  55.67 
 
 
476 aa  526  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  45.82 
 
 
461 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  47.18 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  45.66 
 
 
461 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  43.42 
 
 
463 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  45.98 
 
 
460 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  43.96 
 
 
460 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  45.59 
 
 
459 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  42.59 
 
 
463 aa  359  6e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  43.45 
 
 
458 aa  358  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  42.3 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  41.77 
 
 
468 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  44.26 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  45.66 
 
 
461 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  42.62 
 
 
458 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  41.37 
 
 
474 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  45.25 
 
 
461 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  41.41 
 
 
471 aa  349  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  42.94 
 
 
465 aa  348  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  42.51 
 
 
466 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  42.51 
 
 
469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  42.71 
 
 
469 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  42.51 
 
 
469 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  42.83 
 
 
469 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  42.04 
 
 
469 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  42.3 
 
 
469 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  41.03 
 
 
465 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  42.8 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  39.83 
 
 
460 aa  339  8e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  42.71 
 
 
469 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  40.38 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  42.54 
 
 
469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  44.54 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  41.25 
 
 
461 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  40.12 
 
 
465 aa  336  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  40.37 
 
 
504 aa  336  5.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  43.24 
 
 
462 aa  335  9e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  43.06 
 
 
470 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  41.88 
 
 
471 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  42.36 
 
 
465 aa  330  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  40.83 
 
 
465 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  40.38 
 
 
472 aa  329  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  41.92 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  41.92 
 
 
469 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  38.97 
 
 
470 aa  325  9e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  41.49 
 
 
466 aa  325  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  41.12 
 
 
517 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  41.27 
 
 
469 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  40.66 
 
 
465 aa  323  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  40.95 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  40.62 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  41.15 
 
 
470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  38.1 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  41.37 
 
 
471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  41.84 
 
 
462 aa  319  9e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  39.92 
 
 
471 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>