252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2401 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2401  metallophosphoesterase  100 
 
 
260 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146399  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2991  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  60.78 
 
 
268 aa  335  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  54.94 
 
 
254 aa  295  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0463  metallophosphoesterase  57.43 
 
 
263 aa  295  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  51.79 
 
 
252 aa  288  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0615  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  52.4 
 
 
261 aa  280  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4118  metallophosphoesterase  49.79 
 
 
248 aa  267  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0595  metallophosphoesterase  53.47 
 
 
247 aa  265  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13086  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1778  hypothetical protein  39.61 
 
 
262 aa  187  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0210  hypothetical protein  33.76 
 
 
242 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  32.92 
 
 
250 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  30.58 
 
 
246 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1996  metallophosphoesterase  31.3 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  34.84 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2170  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
252 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0370  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0275  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  29.96 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  30.67 
 
 
246 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  29.41 
 
 
236 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
239 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  24.69 
 
 
239 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2574  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.07 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447358  hitchhiker  0.00093779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3511  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.85 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41400  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.66 
 
 
240 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2755  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.68 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000777525  normal  0.0623291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2095  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.87 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3745  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.31 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1588  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.68 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000609935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.68 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000416228  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1619  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.8 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640111  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.2 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1599  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.23 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000220197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1732  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.14 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0404119  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.83 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000354369  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2897  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.734738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
301 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  29.64 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  29.18 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1245  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.18 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000179649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2666  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.83 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392649  normal  0.131965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2568  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00051853  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2902  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.44 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536345  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2881  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.44 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.16 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2920  metallophosphoesterase  25.31 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.44 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2315  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.38 
 
 
277 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.579975  hitchhiker  0.000892326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2686  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.42 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000748093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2404  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.695626  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  28 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1938  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.05 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.23 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3641  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.76 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.371188  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.4 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  27.04 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
265 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1344  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.53 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3016  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.62 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.63906e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1276  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.19 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740035  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3154  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.19 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  27.9 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  28.35 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01840  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.72 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  26.42 
 
 
352 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2252  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.68 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003839  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.19 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000282951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
267 aa  59.7  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2936  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.89 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0174244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2054  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.16 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  28.93 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1886  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.26 
 
 
246 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0836834  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1656  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.66 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.196115  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.66 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  27.9 
 
 
270 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0992  hypothetical protein  27.35 
 
 
282 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.15 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.172391  decreased coverage  0.000000286595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0919  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.89 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0498  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.09 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1160  metallophosphoesterase  25.66 
 
 
352 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0178  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.78 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0855  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.83 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3207  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
374 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.949256  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  28.69 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>