203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2991 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2991  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  100 
 
 
268 aa  556  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2401  metallophosphoesterase  60.78 
 
 
260 aa  335  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146399  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0463  metallophosphoesterase  55.94 
 
 
263 aa  298  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  52.17 
 
 
254 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  50.39 
 
 
252 aa  277  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0615  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  52.19 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4118  metallophosphoesterase  53.2 
 
 
248 aa  268  7e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0595  metallophosphoesterase  48.02 
 
 
247 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13086  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1778  hypothetical protein  38.46 
 
 
262 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1996  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
246 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
250 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0210  hypothetical protein  28.63 
 
 
242 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2170  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  32.27 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0370  metallophosphoesterase  30.92 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  27.42 
 
 
246 aa  99  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
241 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  27.8 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0275  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  29.24 
 
 
236 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  26.21 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  23.14 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2897  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.734738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.1 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0498  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.84 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.93 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0692  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.37 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715395  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2514  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.45 
 
 
265 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0010168  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1342  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.9 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.144887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2920  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
238 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
265 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.11 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.36 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0663  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.02 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00114887  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
655 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2936  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.81 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0174244  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  29.68 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  28.28 
 
 
301 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1199  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.68 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0849494 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  28.97 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1098  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.75 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
357 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  27.54 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1656  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.78 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.196115  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.78 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1004  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.43 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0775768  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  28.69 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0827  metallophosphoesterase  28.09 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2153  metallo-phosphoesterase  27.35 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11023  calcineurin-like phosphoesterase  23.05 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.639747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1276  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.67 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740035  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2663  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.94 
 
 
241 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.191916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01840  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.85 
 
 
220 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3154  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.67 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0178  metallophosphoesterase  26.38 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3346  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5388  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.03 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1160  metallophosphoesterase  31.41 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2095  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.75 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.82 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  27.82 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1619  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.75 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640111  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3207  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
374 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.949256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  34.92 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2101  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.03 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.471893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  28.34 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2054  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.29 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238399  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5995  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.03 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.22 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000354369  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  27.12 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2082  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.03 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0753294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2574  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.11 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447358  hitchhiker  0.00093779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3016  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.27 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.63906e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1509  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.71 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1474  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.71 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0919  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.8 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1900  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.84 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00121959  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1245  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.94 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0632  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1394  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.49 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501368 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4032  metallophosphoesterase  23.21 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1532  metallophosphoesterase  26.73 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  26.23 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  32.08 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2252  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.27 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
273 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3207  metallophosphoesterase  26.85 
 
 
374 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.603863  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
288 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0823  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
268 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  30.61 
 
 
355 aa  52  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>