115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1532 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1532  metallophosphoesterase  100 
 
 
245 aa  501  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0203  hypothetical protein  42.11 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000441188  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1371  hypothetical protein  37.22 
 
 
242 aa  150  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0329  metallophosphoesterase  38.96 
 
 
239 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1308  metallophosphoesterase  37.44 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1578  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  35.1 
 
 
263 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.483379  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1655  metallophosphoesterase  38.46 
 
 
253 aa  135  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.12955  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1685  hypothetical protein  35.55 
 
 
211 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.438779  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0334  hypothetical protein  34.6 
 
 
211 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0312  hypothetical protein  35.07 
 
 
211 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2920  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
238 aa  77  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  28.22 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  27.04 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  29.02 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.11 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  23.11 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4118  metallophosphoesterase  31 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  23.08 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0463  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2881  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.28 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2404  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.77 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.695626  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0983  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.98 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.25629  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0210  hypothetical protein  25.41 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.28 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0498  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.91 
 
 
234 aa  55.8  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0855  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.57 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2897  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.734738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  27.23 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  22.65 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2902  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.78 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536345  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0563  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.59 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0450  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.59 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000427615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1996  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2991  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.73 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0569  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.59 
 
 
240 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104909  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00474  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.59 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000858557  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00479  hypothetical protein  19.59 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3794  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.43 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2574  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.45 
 
 
242 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447358  hitchhiker  0.00093779 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0625  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.59 
 
 
240 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00154734  normal  0.83573 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3089  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.07 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000401523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0599  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.07 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000105998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3098  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  19.07 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000730792  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2170  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2186  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.22 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0914569  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
325 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0827  metallophosphoesterase  22.64 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2401  metallophosphoesterase  22.77 
 
 
260 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146399  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2158  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.49 
 
 
250 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4016  hypothetical protein  32.17 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.87 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3641  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.18 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.371188  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2153  metallo-phosphoesterase  22.64 
 
 
268 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1344  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.97 
 
 
276 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0495  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.94 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000716976  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1886  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.61 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0836834  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2070  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.01 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3745  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.69 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
655 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0816  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.7 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0588  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.1 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.02313  normal  0.128446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0643  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.1 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0580  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.1 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.155897 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1905  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.48 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  22.84 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0615  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26 
 
 
261 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  26.41 
 
 
268 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02499  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.7 
 
 
247 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  18.56 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717759  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  24.88 
 
 
309 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3511  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.84 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103519  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0532  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.83 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.422385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1004  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.4 
 
 
272 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0775768  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1276  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.23 
 
 
240 aa  45.4  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740035  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3154  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.23 
 
 
240 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
332 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
355 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2663  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.1 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.191916  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41400  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.34 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3016  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.23 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.63906e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
312 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01975  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.29 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1732  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.36 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0404119  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  23.81 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0109  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.88 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  24.07 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0581  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.62 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016997  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  24.07 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2095  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.78 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.5 
 
 
283 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0919  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.16 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1619  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.78 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0583  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  20.1 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000344944  normal  0.532783 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  24.77 
 
 
313 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>