100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0203 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0203  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  513  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000441188  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1371  hypothetical protein  39 
 
 
242 aa  170  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1532  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1578  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  38.59 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.483379  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0329  metallophosphoesterase  38.79 
 
 
239 aa  149  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1655  metallophosphoesterase  38.17 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.12955  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1308  metallophosphoesterase  36.73 
 
 
239 aa  144  9e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1685  hypothetical protein  36.36 
 
 
211 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.438779  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0334  hypothetical protein  35.89 
 
 
211 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0312  hypothetical protein  35.89 
 
 
211 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  26.53 
 
 
241 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2897  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.734738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  24.55 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0919  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.73 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  21.82 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2920  metallophosphoesterase  27.36 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.33 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000416228  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1588  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.33 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000609935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  31.58 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000354369  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1599  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.67 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000220197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1485  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.77 
 
 
241 aa  52  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000036384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01975  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.51 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2755  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.67 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000777525  normal  0.0623291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1619  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.1 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640111  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.14 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1900  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.89 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00121959  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1509  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.63 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2568  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.77 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00051853  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.57 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2666  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.67 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392649  normal  0.131965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1004  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.95 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0775768  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  28.69 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2574  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.76 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447358  hitchhiker  0.00093779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2095  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.36 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2315  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.09 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.579975  hitchhiker  0.000892326 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1474  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.25 
 
 
242 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  27.46 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.56 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  27.82 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3511  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.64 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1996  metallophosphoesterase  25.83 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1098  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.17 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_002950  PG1778  hypothetical protein  27.08 
 
 
262 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1937  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.28 
 
 
266 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2897  metallophosphoesterase  26.89 
 
 
266 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0189473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.69 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00783513  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0933  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.27 
 
 
240 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.118833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2186  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.71 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0914569  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2991  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.69 
 
 
268 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2881  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.37 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1245  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.33 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000179649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2170  metallophosphoesterase  33.68 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41400  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2601  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.21 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4118  metallophosphoesterase  30.84 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1344  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.7 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  23.02 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2102  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.1 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0120187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0580  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.11 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.155897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0370  metallophosphoesterase  25 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0643  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.11 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2663  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.81 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.191916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2902  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.88 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536345  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0588  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.11 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.02313  normal  0.128446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  23.57 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0532  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.16 
 
 
243 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.422385  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2153  metallo-phosphoesterase  26.79 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0855  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.1 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1668  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.16 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.138267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  28 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1847  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.81 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2163  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.83 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1732  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.32 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0404119  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3152  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.83 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2549  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.83 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2600  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.83 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1436  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.83 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0823  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1660  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.83 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1918  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.69 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
655 aa  43.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0827  metallophosphoesterase  25.89 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2459  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.06 
 
 
283 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210688  normal  0.862595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4032  metallophosphoesterase  26.13 
 
 
283 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2685  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.83 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3094  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.48 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3794  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.44 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.34 
 
 
240 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.73 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.172391  decreased coverage  0.000000286595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1812  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.98 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0625  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.87 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00154734  normal  0.83573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0463  metallophosphoesterase  27.88 
 
 
263 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3745  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.32 
 
 
248 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1886  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.64 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0836834  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0583  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.17 
 
 
240 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000344944  normal  0.532783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0581  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.17 
 
 
240 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.93 
 
 
240 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.717759  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0495  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.35 
 
 
248 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000716976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>