73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1371 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1371  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0334  hypothetical protein  58.65 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1685  hypothetical protein  58.65 
 
 		 211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.438779  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0312  hypothetical protein  58.17 
 
 		 211 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1655  metallophosphoesterase  46.09 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.12955  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0329  metallophosphoesterase  46.61 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1578  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  41.18 
 
 		 263 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.483379  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1308  metallophosphoesterase  44.75 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0203  hypothetical protein  39 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000441188  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1532  metallophosphoesterase  37.22 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2920  metallophosphoesterase  28.19 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  28.14 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  27.75 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  33.91 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  25.99 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  33.05 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2936  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.55 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0174244  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  23.53 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2897  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.734738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3794  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.57 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.03 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0532  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.41 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.422385  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1656  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.28 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.196115  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.28 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.19 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1344  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.83 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.81 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000416228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3641  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.58 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.371188  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01975  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.82 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1732  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.64 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0404119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1668  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.99 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.138267  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1342  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.85 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.144887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0498  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.5 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2666  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.71 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392649  normal  0.131965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1599  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.33 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000220197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2755  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.81 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000777525  normal  0.0623291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  24.89 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  22.4 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3745  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.64 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1588  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.81 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000609935  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  24.88 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1886  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.3 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0836834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.94 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000354369  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  26.87 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4016  hypothetical protein  28.81 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3025  metallophosphoesterase  31.33 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  23.39 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0919  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.69 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1536  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.69 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2568  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.93 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00051853  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0823  metallophosphoesterase  20.55 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0109  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.94 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.44 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  19.71 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  23.63 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0632  metallophosphoesterase  24.39 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0975218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0264  hypothetical protein  30.56 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.785329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0275  metallophosphoesterase  18.88 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1004  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.78 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0775768  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  22.09 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1245  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.23 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1485  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.75 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000036384  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  20.83 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1474  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1509  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0178  metallophosphoesterase  25 
 
 		 278 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  22 
 
 		 290 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  28.97 
 
 		 360 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  34.48 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0855  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.64 
 
 		 262 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  22.45 
 
 		 290 aa  41.6  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  21.99 
 
 		 332 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  25.81 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>