176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0275 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0275  metallophosphoesterase  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4118  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
248 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0463  metallophosphoesterase  31.38 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2401  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146399  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
254 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.92 
 
 
252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0615  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.69 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0595  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0370  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
248 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133042  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1778  hypothetical protein  29.37 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0210  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2991  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.9 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  28.05 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2170  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1996  metallophosphoesterase  28.64 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  29.11 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  29.39 
 
 
241 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0919  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.18 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0329  metallophosphoesterase  22.94 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  29.28 
 
 
286 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1199  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.44 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0849494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5388  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5995  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2082  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2101  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.471893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  27.07 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2117  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4032  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.3 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.440404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0498  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.64 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2902  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.21 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536345  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3641  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.99 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.371188  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  27.27 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2881  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.71 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.21 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2404  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.695626  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  28.76 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1660  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2163  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3152  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2549  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2600  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1436  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2685  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159841  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1656  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.5 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.196115  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.5 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3745  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.5 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1937  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.22 
 
 
266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203837  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1308  metallophosphoesterase  19.07 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1812  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.35 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41400  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.92 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2663  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.3 
 
 
241 aa  52.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.191916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1394  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.78 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2666  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.36 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392649  normal  0.131965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1245  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.2 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000179649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  31 
 
 
241 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11023  calcineurin-like phosphoesterase  22.98 
 
 
282 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.639747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1732  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.54 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0404119  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.51 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  28.03 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2514  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.41 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0010168  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2568  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.36 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00051853  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  25.69 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  24.16 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
273 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4577  metallophosphoesterase  22.54 
 
 
274 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1668  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.19 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.138267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3511  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  31.53 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.97 
 
 
421 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1441  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.24 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436249  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0532  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.19 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.422385  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  24.44 
 
 
352 aa  49.7  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0992  hypothetical protein  26.09 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1938  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.9 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  26.14 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  25.75 
 
 
315 aa  48.5  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00474  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.09 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000858557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3089  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.08 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000401523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1318  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.38 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.51 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.94 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000354369  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3098  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.08 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000730792  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00479  hypothetical protein  27.09 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  24.69 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1485  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.44 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000036384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0599  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.08 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000105998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.87 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000416228  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  28.27 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2186  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.9 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0914569  normal  0.239583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0569  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.08 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104909  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0632  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0975218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>