188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1778 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1778  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  538  9.999999999999999e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4118  metallophosphoesterase  39.38 
 
 
248 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0463  metallophosphoesterase  40.78 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  38.76 
 
 
254 aa  187  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2401  metallophosphoesterase  39.61 
 
 
260 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146399  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2991  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  38.46 
 
 
268 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  36.05 
 
 
252 aa  181  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0595  metallophosphoesterase  37.21 
 
 
247 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13086  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0615  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  35.8 
 
 
261 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
246 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0210  hypothetical protein  32.93 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  29.66 
 
 
242 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  28.91 
 
 
250 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1996  metallophosphoesterase  29.59 
 
 
245 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2170  metallophosphoesterase  29.54 
 
 
252 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0370  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0275  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
249 aa  96.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  30.62 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
239 aa  89.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  29.13 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  27.53 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2920  metallophosphoesterase  28.74 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3641  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.92 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.371188  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1588  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.44 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000609935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.44 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000416228  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2574  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.6 
 
 
242 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447358  hitchhiker  0.00093779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2902  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.91 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536345  normal  0.442088 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2686  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.02 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000748093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1599  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.44 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000220197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2755  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.44 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000777525  normal  0.0623291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.24 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2514  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.82 
 
 
265 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0010168  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2881  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.44 
 
 
240 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1812  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.25 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41400  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.77 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.44 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.32 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1509  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.9 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1732  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.42 
 
 
248 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0404119  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1656  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.32 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.196115  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  28.03 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3745  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.73 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.459714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2252  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.97 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.27 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000354369  normal  0.0104928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  29.5 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2404  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.75 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.695626  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1441  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.74 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1886  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.69 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0836834  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0816  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.44 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.88 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1474  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.5 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2568  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.88 
 
 
239 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00051853  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3511  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.08 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.103519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0919  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.33 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  26.45 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2666  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.48 
 
 
239 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392649  normal  0.131965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  23.17 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
275 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  29.37 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3089  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
240 aa  52  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000401523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3098  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
240 aa  52  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000730792  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0599  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
240 aa  52  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000105998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2101  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.21 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.471893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0495  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.17 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000716976  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1394  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25.42 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0569  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104909  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00474  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.54 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000858557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.98 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5388  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.21 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2500  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.69 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00783513  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5995  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.21 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2082  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.21 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0753294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2897  metallophosphoesterase  28.8 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.734738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.56 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.440404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00479  hypothetical protein  24.54 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00158134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0178  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2117  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.56 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276772  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1619  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.25 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640111  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2095  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.25 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01840  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0498  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.36 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1938  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.4 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0983  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.18 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.25629  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1199  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.56 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0849494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0563  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.54 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0450  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.54 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000427615  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4032  metallophosphoesterase  31.97 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0933  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.54 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.118833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0625  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.54 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00154734  normal  0.83573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1485  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  21.88 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000036384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
288 aa  49.3  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
270 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
289 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1164  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.43 
 
 
240 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000107116  hitchhiker  0.00427171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1276  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  23.87 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740035  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2513  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.92 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>