222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2578 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  100 
 
 
289 aa  603  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  53.81 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.81 
 
 
273 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  49.43 
 
 
270 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  52.65 
 
 
274 aa  279  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  52.97 
 
 
265 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  52.54 
 
 
265 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  51.27 
 
 
273 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  52.54 
 
 
270 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000165478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  52.54 
 
 
270 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  52.97 
 
 
270 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  48.33 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  51.27 
 
 
271 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  50.63 
 
 
279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  46.44 
 
 
276 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  46.33 
 
 
270 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  49.17 
 
 
270 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  49.17 
 
 
270 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  48.4 
 
 
289 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  49.58 
 
 
280 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  44.36 
 
 
301 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  44.53 
 
 
290 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  46.64 
 
 
265 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  45.67 
 
 
288 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  47.15 
 
 
275 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  48.54 
 
 
272 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  44.7 
 
 
275 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  46.72 
 
 
296 aa  255  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  46.72 
 
 
296 aa  255  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  47.54 
 
 
286 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  46.77 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  48.32 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1735  metallophosphoesterase  48.54 
 
 
303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0014324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  48.95 
 
 
286 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  42.54 
 
 
309 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  44.49 
 
 
270 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  46.44 
 
 
322 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  43.63 
 
 
309 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  46.91 
 
 
315 aa  248  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  46.56 
 
 
269 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  42.58 
 
 
332 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  46.64 
 
 
273 aa  245  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  42.11 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2234  metallophosphoesterase  44.13 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  43.02 
 
 
316 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  42.08 
 
 
290 aa  241  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  45.8 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.81 
 
 
312 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  43.68 
 
 
270 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  44.77 
 
 
314 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  44.49 
 
 
255 aa  240  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  43.03 
 
 
267 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  45.42 
 
 
277 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  45.64 
 
 
286 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  41.64 
 
 
312 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.26 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  44.26 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  45.64 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  45.61 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  41.42 
 
 
330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.26 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.26 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.26 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.26 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  44.26 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  45.23 
 
 
265 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  41.42 
 
 
312 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  41.42 
 
 
312 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  41.42 
 
 
312 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  43.93 
 
 
312 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  43.93 
 
 
355 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  42.29 
 
 
313 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  46.44 
 
 
265 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  43.41 
 
 
278 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  42.29 
 
 
313 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  44.26 
 
 
265 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  43.85 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  43.98 
 
 
315 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  44.81 
 
 
265 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  40.87 
 
 
268 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  46.28 
 
 
300 aa  228  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0018  metallophosphoesterase  41.83 
 
 
283 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.511643  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  42 
 
 
283 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  43.28 
 
 
284 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  41.29 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.29 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  44.12 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  40.47 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3025  metallophosphoesterase  43.15 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2538  metallophosphoesterase  42.68 
 
 
269 aa  203  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3813  calcineurin-like phosphoesterase  41.35 
 
 
298 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  34.56 
 
 
360 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  34.54 
 
 
357 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1239  hypothetical protein  38.49 
 
 
352 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  39.84 
 
 
355 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  34.56 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3207  metallophosphoesterase  37.97 
 
 
374 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.603863  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3207  metallophosphoesterase  38.28 
 
 
374 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.949256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3659  metallophosphoesterase  38.43 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3346  metallophosphoesterase  38.28 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>