260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0370 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0370  metallophosphoesterase  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.133042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2358  metallophosphoesterase  64.73 
 
 
250 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2170  metallophosphoesterase  68.33 
 
 
252 aa  324  8.000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1996  metallophosphoesterase  53.97 
 
 
245 aa  293  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0210  hypothetical protein  58.09 
 
 
242 aa  291  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0240  hypothetical protein  60.42 
 
 
242 aa  289  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2224  metallophosphoesterase  56.49 
 
 
246 aa  284  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4118  metallophosphoesterase  34.33 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0615  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  32.74 
 
 
261 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0463  metallophosphoesterase  31.74 
 
 
263 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2401  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
260 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146399  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02835  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  31.33 
 
 
252 aa  135  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.870418  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0614  metallophosphoesterase  30.87 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2991  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.92 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0595  metallophosphoesterase  30.61 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0275  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
249 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1778  hypothetical protein  29.62 
 
 
262 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1978  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  34.31 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0635  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0667206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2776  metallophosphoesterase  25.32 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.524737  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
278 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  26.48 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0498  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  25 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  26.8 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1118  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.38 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0995224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1622  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  31.94 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0578  metallophosphoesterase  25.42 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00264084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  26.81 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0591  metallophosphoesterase  27 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000500765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.81 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  28.85 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2514  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.56 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0010168  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  25.3 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
280 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4032  metallophosphoesterase  30.38 
 
 
283 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11023  calcineurin-like phosphoesterase  26.89 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.639747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1656  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.6 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.196115  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.6 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  28.51 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  26.91 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1098  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.5 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000165478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.81 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  28.51 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0178  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  28.11 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2897  metallophosphoesterase  27.62 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.734738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4577  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1004  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.95 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0775768  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0983  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.86 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.25629  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1987  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.93 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.440404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2117  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.93 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
655 aa  67  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  25.49 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5388  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  30.28 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2456  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase, putative  24.58 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3154  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.45 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1276  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.45 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740035  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  26.91 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2574  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.6 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.447358  hitchhiker  0.00093779 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5995  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.58 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2082  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.58 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0753294  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  24.39 
 
 
300 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1619  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.99 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.640111  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3794  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  22.89 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0643  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.31 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2101  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.58 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.471893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2095  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  28.99 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0580  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.75 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.155897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1199  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.58 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0849494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0588  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  27.31 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.02313  normal  0.128446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  26.45 
 
 
325 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  24.4 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3016  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.02 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.63906e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3641  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.67 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.371188  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2881  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.9 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2789  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  24.9 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.812718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.6 
 
 
273 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0495  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.67 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000716976  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  25.6 
 
 
273 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2685  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.79 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.159841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  26.5 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0583  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  26.87 
 
 
240 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000344944  normal  0.532783 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1660  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.79 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2600  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.79 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2549  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.79 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3152  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.79 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1436  UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  29.79 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>