More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09120 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09120  RNAse PH  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.255982  normal  0.080904 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  64.35 
 
 		 253 aa  288  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2535  ribonuclease PH  57.2 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 238 aa  258  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 238 aa  257  9e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2365  ribonuclease PH  57.63 
 
 		 239 aa  257  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  56.36 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3641  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 240 aa  255  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  55.7 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  54.2 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  55 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0385  ribonuclease PH  56.78 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0971657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  56.12 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  54.85 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0182  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 238 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0469  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.221251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  52.12 
 
 		 263 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1971  ribonuclease PH  54.89 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.402894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1352  ribonuclease PH  53.88 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000399193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0167  ribonuclease PH  55.46 
 
 		 238 aa  248  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1616  ribonuclease PH  53.81 
 
 		 245 aa  248  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  55.98 
 
 		 240 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11370  ribonuclease PH  54.39 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.358864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  55.98 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  54.2 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  54.85 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1795  ribonuclease PH  53.59 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0594826  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0173  ribonuclease PH  55.04 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  51.48 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4287  ribonuclease PH  54.81 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  52.74 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  54.2 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  52.94 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  53.75 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2311  ribonuclease PH  54.43 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  52.32 
 
 		 244 aa  244  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  52.54 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2474  ribonuclease PH  55.95 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 243 aa  244  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  54.08 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  54.08 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  53.75 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0401  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  54.59 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  56.02 
 
 		 237 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  52.74 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0434  ribonuclease PH  54.66 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197772  normal  0.874562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  55.51 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2943  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 237 aa  241  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.773664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2151  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 237 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  53.65 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  54.08 
 
 		 243 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4763  ribonuclease PH  52.97 
 
 		 237 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  54.15 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  53.22 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  53.3 
 
 		 238 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  54.15 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  54.15 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  54.15 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  54.15 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  52.99 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0193  ribonuclease PH  54.24 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2326  ribonuclease PH  51.95 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00168859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1323  ribonuclease PH  56.9 
 
 		 242 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  53.65 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  55.08 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  54.01 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  54.74 
 
 		 238 aa  238  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4253  ribonuclease PH  53.39 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  52.54 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0006  ribonuclease PH  52.1 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0006  ribonuclease PH  51.9 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.105449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  52.52 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  53.36 
 
 		 238 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  51.05 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>