70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0742 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  100 
 
 		 288 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  100 
 
 		 288 aa  600  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  49.13 
 
 		 346 aa  353  1e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  49.57 
 
 		 349 aa  348  4e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  46.63 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  47.12 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  43.94 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  39.11 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  38.85 
 
 		 374 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  37.63 
 
 		 375 aa  250  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  48.95 
 
 		 367 aa  249  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  38.58 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  35.35 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  21.65 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  23.21 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  20.98 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  23.88 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  22.75 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  29.34 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  24.5 
 
 		 245 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  22.87 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  22.87 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  22.87 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  22.93 
 
 		 250 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  23.08 
 
 		 240 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  25 
 
 		 243 aa  52.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2353  cytochrome c1  22.63 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.922589  hitchhiker  0.000000000801731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  28.57 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2731  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  22.63 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0309003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  21.74 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  25.64 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  19.73 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  24 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  19.42 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  18.45 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  23.91 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  26.32 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  27.07 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  27.07 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  22.56 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1343  cytochrome c1  25.6 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035457  normal  0.0260958 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  22.22 
 
 		 257 aa  45.8  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  21.83 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  23.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  20.26 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.78 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.78 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  24 
 
 		 743 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  23.3 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1177  cytochrome c class I  28.68 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  20.1 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  21.49 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  23.39 
 
 		 408 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3111  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  25 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2709  cytochrome c1  25 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000107976  unclonable  0.0000000000354845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  20.79 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  21.26 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  23.78 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  22.6 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  20.5 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  20.3 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  20.3 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  20.3 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  20.3 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  20.98 
 
 		 252 aa  42.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  18.84 
 
 		 244 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>