50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1919 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  100 
 
 		 315 aa  653    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  47.12 
 
 		 288 aa  285  9e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  47.12 
 
 		 288 aa  285  9e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  39.26 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  38.69 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  37.57 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  38.34 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  41.29 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  32 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  33.67 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  33.67 
 
 		 374 aa  195  7e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  34.03 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  23.4 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  24.87 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  24.06 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  22.45 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  22.99 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  23.28 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  24.14 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  21.36 
 
 		 251 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  21.89 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  31.33 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  22.99 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  24.7 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  21.65 
 
 		 240 aa  51.2  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  22.99 
 
 		 232 aa  49.7  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  21.39 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  21.93 
 
 		 232 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  21.93 
 
 		 232 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  21.93 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  22.99 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  22.77 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  22.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  22.99 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  22.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  22.22 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  22.61 
 
 		 246 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  23.26 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  22.61 
 
 		 248 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0905  cytochrome c1-like protein  21.03 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  21.61 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  19.9 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  27.78 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  21.64 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  19.5 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  20.4 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.5 
 
 		 243 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1422  ubiquinol cytochrome c1 reductase  26.74 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00068249  normal  0.213297 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  21.64 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4405  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  21.86 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>