26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1095 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  100 
 
 		 375 aa  774    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  60.85 
 
 		 374 aa  457  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  60.58 
 
 		 374 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  60.32 
 
 		 374 aa  434  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  45.14 
 
 		 349 aa  335  7e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  45 
 
 		 346 aa  335  9e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  47.89 
 
 		 341 aa  332  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  39.31 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  37.63 
 
 		 288 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  37.63 
 
 		 288 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  32 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  24.56 
 
 		 248 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  22.06 
 
 		 246 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  33.33 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  21.11 
 
 		 240 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  23.56 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1416  hypothetical protein  25.42 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  21.99 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  34.62 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0263  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.41 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  21.48 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  19.9 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  20.32 
 
 		 232 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.37 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>