60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1318 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0545  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  98.93 
 
 		 374 aa  761    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  100 
 
 		 374 aa  768    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1199  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  98.4 
 
 		 374 aa  760    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1095  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome c1 subunit  60.58 
 
 		 375 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1919  cytochrome c subfamily protein  48.82 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1816  hypothetical protein  47.12 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000760007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1450  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  46.98 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.20363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1236  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  39.95 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1833  cytochrome c subfamily protein  39.11 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.135185  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0742  cytochrome c subfamily protein  39.11 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 278 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000371587  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1919  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  33.67 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233751  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1535  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  34 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000513902  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  24.23 
 
 		 246 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  24.48 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  26.06 
 
 		 250 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1416  hypothetical protein  25.64 
 
 		 252 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  30.66 
 
 		 231 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  25.55 
 
 		 233 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  20.81 
 
 		 240 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  28.47 
 
 		 233 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1070  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  25.41 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  20.14 
 
 		 247 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  24.53 
 
 		 747 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  21.29 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  26.14 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  28.26 
 
 		 233 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  21.29 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  25.28 
 
 		 688 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0510  cytochrome c1  27.05 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  22.97 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0346  cytochrome c1  22.97 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  21.9 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.7 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.7 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  19.7 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0522  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  27.05 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0503999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  24.09 
 
 		 231 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  23.57 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.7 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.7 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.7 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  19.7 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  21.85 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  23.02 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  19.72 
 
 		 247 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  18.85 
 
 		 247 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  20.83 
 
 		 245 aa  43.5  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  25.52 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  20.83 
 
 		 245 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  22.67 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  22.67 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  22.67 
 
 		 252 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4530  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  29.89 
 
 		 259 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.490677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0738  cytochrome c1  25.81 
 
 		 269 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0973071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  19.91 
 
 		 251 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  20.83 
 
 		 243 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0926  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  29.89 
 
 		 259 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4690  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  30.23 
 
 		 260 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  29.89 
 
 		 259 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>