187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0601 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0601  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 215 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  97.67 
 
 		 335 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  97.67 
 
 		 335 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  97.67 
 
 		 335 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  94.42 
 
 		 335 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  93.95 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  94.42 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  92.09 
 
 		 335 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  89.77 
 
 		 335 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  80 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  77.67 
 
 		 335 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  76.74 
 
 		 335 aa  363  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  77.1 
 
 		 335 aa  360  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  77.21 
 
 		 335 aa  357  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  73.95 
 
 		 335 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  68.2 
 
 		 337 aa  325  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  66.05 
 
 		 339 aa  318  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  64.06 
 
 		 337 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  65.74 
 
 		 352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  63.13 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  62.5 
 
 		 338 aa  289  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  61.21 
 
 		 335 aa  282  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  59.35 
 
 		 337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  59.26 
 
 		 349 aa  267  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  56.94 
 
 		 346 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  54.21 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  53.27 
 
 		 336 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  53.95 
 
 		 338 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.87 
 
 		 336 aa  238  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  51.4 
 
 		 336 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 336 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  51.63 
 
 		 338 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  50.46 
 
 		 345 aa  228  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  50.23 
 
 		 337 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 345 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  48.64 
 
 		 351 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  48.64 
 
 		 351 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  48.64 
 
 		 351 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  48.64 
 
 		 351 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  48.64 
 
 		 351 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  48.64 
 
 		 351 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  48.64 
 
 		 351 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  47.47 
 
 		 362 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  47.73 
 
 		 347 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  48.18 
 
 		 347 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 		 347 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 		 347 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  47.73 
 
 		 347 aa  211  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  47.47 
 
 		 380 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  47.47 
 
 		 338 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  47.49 
 
 		 349 aa  209  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 		 347 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  46.82 
 
 		 347 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  49.3 
 
 		 355 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  47.03 
 
 		 348 aa  207  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  45.16 
 
 		 341 aa  207  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  45.62 
 
 		 341 aa  205  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  45.78 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  46.54 
 
 		 338 aa  205  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  46.08 
 
 		 341 aa  204  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  47.22 
 
 		 337 aa  204  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  44.24 
 
 		 341 aa  197  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  44.6 
 
 		 341 aa  195  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  44.19 
 
 		 345 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 		 345 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  42.66 
 
 		 347 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  45.93 
 
 		 347 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 		 351 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  43 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  44.28 
 
 		 351 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  44 
 
 		 352 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  39.72 
 
 		 339 aa  178  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  42.06 
 
 		 335 aa  176  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  48.09 
 
 		 347 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  42.86 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  43.65 
 
 		 337 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  45.77 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  41.31 
 
 		 341 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  45.77 
 
 		 347 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  43.28 
 
 		 352 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 		 353 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  43.28 
 
 		 337 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  39.27 
 
 		 348 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  41.78 
 
 		 349 aa  171  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  40.28 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  40.28 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  37.96 
 
 		 333 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 333 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  37.96 
 
 		 333 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 		 337 aa  168  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 351 aa  168  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 333 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  42.44 
 
 		 355 aa  168  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  45.9 
 
 		 336 aa  167  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  42.86 
 
 		 334 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  38.43 
 
 		 332 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.43 
 
 		 333 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 372 aa  164  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>