231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3411 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3411  glutamine amidotransferase  100 
 
 
238 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0545272  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3486  glutamine amidotransferase  98.32 
 
 
238 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3609  glutamine amidotransferase  98.32 
 
 
238 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  92.44 
 
 
238 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  57.74 
 
 
246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  55.7 
 
 
240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  51.05 
 
 
240 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  50 
 
 
239 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  48.74 
 
 
239 aa  247  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  50 
 
 
239 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  49.58 
 
 
239 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  49.58 
 
 
239 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  49.58 
 
 
239 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  47.03 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  38.1 
 
 
228 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  37.66 
 
 
228 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  39.22 
 
 
230 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  34.62 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  32.91 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  32.98 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  31.92 
 
 
226 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.47 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  30.64 
 
 
235 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  31.6 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.13 
 
 
230 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 
231 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.64 
 
 
229 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  33.7 
 
 
288 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  30.74 
 
 
224 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  31.98 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  32.81 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  32.6 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  29.79 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  30.89 
 
 
238 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  30.65 
 
 
244 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  30.11 
 
 
243 aa  92  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  31.17 
 
 
243 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  30.8 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  30.26 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.15 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  27.69 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.1 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  30.69 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.79 
 
 
245 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  32.79 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 
236 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.69 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 
239 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  29.5 
 
 
243 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  30.2 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  32.76 
 
 
241 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  28.95 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.28 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.52 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  28.42 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  26.88 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  28.71 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  33.91 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  28.42 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.39 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  33.55 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  27.59 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  31.46 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  32.8 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  25.99 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  26.9 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  30.68 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  27.47 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  32.03 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  30.73 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  29.02 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  30.81 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  26.8 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  27.66 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  28.87 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  27.47 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  26.16 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  28.43 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>