88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4388 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  99.6 
 
 
248 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4388  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  91.53 
 
 
248 aa  474  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  91.53 
 
 
248 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  91.53 
 
 
248 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  97.58 
 
 
248 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  89.8 
 
 
245 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  82.3 
 
 
251 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  74.5 
 
 
251 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  77.55 
 
 
252 aa  390  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  74.4 
 
 
249 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  75.1 
 
 
244 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  75.41 
 
 
245 aa  380  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  56 
 
 
253 aa  295  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  30.93 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  31.01 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  27.91 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  27.91 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  28.29 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  27.73 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  28.28 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  29.32 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  25.78 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  27.49 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  24.68 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  28.11 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  32.22 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  26.34 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  27.11 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  39.81 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  26.09 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  31.97 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  27.2 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  28.78 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  28.14 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  28.18 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  28.18 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  25.94 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  27.63 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  28.02 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  31.79 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  28.64 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  26.53 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  32.77 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  25.43 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  35.54 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  24.66 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  25.43 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  25.68 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  25.43 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  29.19 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  25.77 
 
 
239 aa  52  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  27.63 
 
 
239 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  28.27 
 
 
241 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  32.54 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  26.52 
 
 
240 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  28.22 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  28.02 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  34.44 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  29.55 
 
 
280 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  26.47 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  26.48 
 
 
273 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  26.32 
 
 
281 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  25.23 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  27.47 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  31.67 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  29.53 
 
 
280 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  25.1 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  26.92 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  29.93 
 
 
229 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  34.48 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  29.72 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  31.52 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  25.45 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  29.93 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  25.67 
 
 
269 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  25.73 
 
 
225 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  25.28 
 
 
298 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  34.62 
 
 
230 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  34.62 
 
 
230 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  34.62 
 
 
230 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>