102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4213 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4388  hypothetical protein  99.59 
 
 
248 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  91.84 
 
 
248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  91.84 
 
 
248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  91.84 
 
 
248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  97.96 
 
 
248 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  90.2 
 
 
245 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  82.74 
 
 
251 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  75.4 
 
 
251 aa  394  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  77.96 
 
 
252 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  76.57 
 
 
249 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  75.52 
 
 
244 aa  384  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  75.82 
 
 
245 aa  384  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  56.63 
 
 
253 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  31.44 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  31.84 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  27.73 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  27.73 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  27.73 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  28.12 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  29.7 
 
 
256 aa  72  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  27.82 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  25.74 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  28.65 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  27.56 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  27.49 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  25.78 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  62  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  26.34 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  26.57 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  27.6 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  29.27 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  32.65 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  28.64 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  28.07 
 
 
231 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  38.89 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  28.57 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  25.11 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  33.91 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  28.07 
 
 
239 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  36.36 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  28.18 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  28.64 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  27.73 
 
 
240 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  29.19 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  31.79 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  28.99 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  26.53 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  25.65 
 
 
240 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  25.65 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  25.65 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  35.56 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  29.19 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  25.86 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  25.68 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  26.52 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  24.8 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  26.96 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  25.22 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  25.69 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  32.17 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  28.02 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  28.02 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  26.36 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  27.47 
 
 
268 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  30.66 
 
 
229 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  30.94 
 
 
280 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  27.27 
 
 
281 aa  48.5  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  35.23 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  31.67 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  31.18 
 
 
230 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  26.48 
 
 
273 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  25.89 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  36.07 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  28.23 
 
 
219 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  26.2 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  25.66 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  26.21 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  36.67 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  29.55 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  29.55 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  28.83 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  33.67 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  31.87 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  29.55 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  32.26 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.36 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.36 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.36 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  30.77 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  26.63 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  25.34 
 
 
271 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  25.44 
 
 
245 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  29.93 
 
 
242 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>