138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0429 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  78.7 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  74.76 
 
 		 229 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  66.52 
 
 		 230 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  64.35 
 
 		 230 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  65.65 
 
 		 230 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  65.65 
 
 		 230 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  65.65 
 
 		 230 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  64.35 
 
 		 230 aa  308  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  63.48 
 
 		 230 aa  307  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  63.04 
 
 		 230 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  63.04 
 
 		 230 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  63.04 
 
 		 228 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  62.17 
 
 		 230 aa  280  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  55.31 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  44.86 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  44.34 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  37.19 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  35.39 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  35.43 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  35.44 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  38.22 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  42.11 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  36.56 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  37.22 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  36.77 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  32.05 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  36.77 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  37.22 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  36.32 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  35.22 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  31.71 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  34.91 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  35.47 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  35.11 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  35.25 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  34.58 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  34.02 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  32.92 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  33.18 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  34.48 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  35.44 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  32.61 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  34.8 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  35.04 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  36.77 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  32.06 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  35.44 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  35.59 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  44.95 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  30.63 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  42.24 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  42.2 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  31.8 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  30.92 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  31.85 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  32.99 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  28.69 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  31.02 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  32.54 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  30.73 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  32.84 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  31.1 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  45.74 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  31.12 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  37.82 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  39.5 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  33.69 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  35.04 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  39.81 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  34.31 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  34.31 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  34.31 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  30.58 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3985  hypothetical protein  30.63 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3246  hypothetical protein  30.91 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.789189 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  34.26 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  37.78 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  37.78 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  32.26 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  29.57 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  33.55 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  31.09 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  29.9 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  34.43 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  36.84 
 
 		 271 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  36.84 
 
 		 271 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  30.62 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  39.62 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  30.23 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  34.74 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  28.63 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  28.79 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1316  hypothetical protein  30.14 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  28.4 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>