136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0478 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  50.86 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  47.72 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  47.3 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  47.3 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  46.47 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  46.47 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  46.06 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  46.06 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  46.06 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  44.03 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  48.13 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  44.86 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  46.54 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  45.68 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  47.98 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  45.61 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  43.72 
 
 		 273 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  44.25 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  42.44 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  39.83 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  39.37 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  37.29 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  33.61 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  35.61 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  35.17 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  36.68 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  34.48 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  32.07 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  35.68 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  36.44 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  34.91 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  32.6 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  42.48 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  41.91 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  34.8 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  42.75 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  33.8 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  32.99 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  33.77 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  45.08 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  45.08 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  45.08 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  31.34 
 
 		 268 aa  85.5  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  40.88 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  31.55 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  32.86 
 
 		 265 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  44.26 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  33.77 
 
 		 240 aa  85.1  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  34.47 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  33.52 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  29.86 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  35.45 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  33.63 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  34.67 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  34.67 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  38.24 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  34.22 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  29.53 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  34.55 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  42.59 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  32.35 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  32.37 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  31.48 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  29.15 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  30.83 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  35.12 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  29.56 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  36.04 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  27.67 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  34.48 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  33.65 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  32.89 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  30.6 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  27.67 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  30.6 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  29.12 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  33.19 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  37.34 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  32.24 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  34.78 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  29.94 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  33.15 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  28.04 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  31.65 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  31.16 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  31.53 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  39.77 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  30.27 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  47.78 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  33.51 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  32.02 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3108  hypothetical protein  31.4 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  25.89 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>