129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  43.3 
 
 
245 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  34.62 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  35.17 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  35.16 
 
 
240 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  28.06 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  32.81 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  35.78 
 
 
240 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  35.78 
 
 
240 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  26.07 
 
 
242 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  26.58 
 
 
237 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  34.47 
 
 
240 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  34.47 
 
 
240 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  33.76 
 
 
240 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  34.04 
 
 
240 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  34.15 
 
 
221 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  30.67 
 
 
256 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  34.63 
 
 
240 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  25.64 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  34.55 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  32.05 
 
 
231 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  33.48 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  33.71 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  34.18 
 
 
229 aa  95.5  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  35.79 
 
 
229 aa  95.5  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  31.09 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  33.04 
 
 
230 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  32.59 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  36.32 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  33.05 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  32.7 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  33.66 
 
 
230 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  31.88 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  35.09 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  32.57 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  31.82 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  33.17 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  33.17 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  33.17 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3043  putative lipoprotein  26.91 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  34.63 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  30.54 
 
 
219 aa  86.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  30.49 
 
 
228 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  38.33 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  33.6 
 
 
245 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  30.63 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  32.88 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  30.6 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  31.94 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  33.01 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  28.3 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  34.29 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  32.87 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2255  hypothetical protein  24.22 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  38.35 
 
 
267 aa  79  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  35.8 
 
 
223 aa  79  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  38.36 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09830  hypothetical protein  24.79 
 
 
240 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3520  hypothetical protein  23.77 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  30.3 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  23.81 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  30.3 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  31.22 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  39.17 
 
 
225 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  37.4 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  29.49 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  30.51 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  36.23 
 
 
234 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  30.64 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  31.22 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  29.96 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  31.82 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  35.34 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  31.33 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  29.71 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  29.25 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  33.55 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  36 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  29.37 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  35.86 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  30.93 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  36.67 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  35.33 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  38.74 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  38.33 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  31.16 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  29.13 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  40.38 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  26.85 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3481  hypothetical protein  23.96 
 
 
312 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352755  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  25.39 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  26.89 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  36.43 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  34.34 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  26.42 
 
 
279 aa  59.3  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  26.42 
 
 
323 aa  58.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>