126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1664 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  58.97 
 
 
278 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  44.25 
 
 
265 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  47.37 
 
 
266 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  47.15 
 
 
265 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  46 
 
 
271 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  45.6 
 
 
269 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  45.34 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  45.2 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  44.08 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  43.27 
 
 
268 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  39.43 
 
 
234 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  34.75 
 
 
257 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  38.26 
 
 
272 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  29.62 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  33.45 
 
 
265 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  32.62 
 
 
259 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  32.39 
 
 
263 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  35.11 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  34.55 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  32.37 
 
 
229 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  34.21 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  31.74 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  39.1 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  37.2 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  31 
 
 
243 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  43.43 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  32.68 
 
 
236 aa  79  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  29.08 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  30.56 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  27.71 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  30.12 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  35.86 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  27.78 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  36.09 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  33.62 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  35.9 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  28.11 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  28.73 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  33.83 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  35.58 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  35.94 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  33.57 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  27.69 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  34.26 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  29.71 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  36.54 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  33.1 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  31.88 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  33.1 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  33.1 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  31.88 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  31.88 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  28.38 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  38.74 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  26.07 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  31.82 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  28.75 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  34.62 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  29.17 
 
 
240 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  35.87 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  33.59 
 
 
230 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  28.19 
 
 
240 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  29.29 
 
 
240 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  38.61 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  41.33 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  29.58 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  28.87 
 
 
240 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  32.82 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  30.83 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  28.75 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  27.27 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  28.03 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  32.26 
 
 
219 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  34.94 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  26.97 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  31.03 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  28.32 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  25.59 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  31.25 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  31.52 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  31.25 
 
 
240 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  31.16 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  31.15 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  33.8 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  34.26 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  30.58 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3481  hypothetical protein  31.29 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352755  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  30.6 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  28.99 
 
 
323 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  31.03 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  28.17 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  31.03 
 
 
237 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  25.77 
 
 
332 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  27.23 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>