90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0030 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  81.56 
 
 		 249 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  86.34 
 
 		 251 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  76.49 
 
 		 248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  76.49 
 
 		 248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  76.89 
 
 		 248 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  78.97 
 
 		 252 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  75.4 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  75.41 
 
 		 245 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  80.27 
 
 		 245 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  73.31 
 
 		 244 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  74.9 
 
 		 248 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  74.9 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4388  hypothetical protein  74.5 
 
 		 248 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  53.36 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  32.99 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  30.36 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  24.69 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  23.87 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  28.93 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  27.43 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  27.31 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  26.92 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  26.92 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  28.82 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  28.19 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  27.97 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  27.75 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  27.68 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  27.48 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  28.19 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  26.89 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  31.31 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  27.04 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  28.19 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  24.02 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  28.02 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  30.71 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  29.02 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  34.21 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  26.05 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  25.78 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  25.33 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  25.32 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  29.73 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  25.85 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  28.3 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  27.8 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  25.57 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  26.27 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  26.24 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  28 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  31.29 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  26.1 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  28.64 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  29.06 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  32.79 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  26.46 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  25.85 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  28.79 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  25.11 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  24.66 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  24.9 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  29.55 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  33.01 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  32.56 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  26.29 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  28.17 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  25.57 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  30.71 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  29.63 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  24.63 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  30.08 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  32.17 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  35.23 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  29.93 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  25.22 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  31.25 
 
 		 230 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  30.58 
 
 		 230 aa  42  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>