102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1600 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  480  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3481  hypothetical protein  36.98 
 
 		 312 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  38.04 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  31.8 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  43.97 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  42.24 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  31.09 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  38.36 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  40.5 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  25.6 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  39.66 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  38.41 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  37.04 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  40.5 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  38.57 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  37.04 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  38.79 
 
 		 265 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  34.64 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  42.06 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  29.44 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  36.23 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.37 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  40.68 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  28.92 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  41.82 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  34.78 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  29.72 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  28.92 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  38.89 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  38.79 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  36.13 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  28.92 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.32 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.32 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.32 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  39.32 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  39.13 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  41.38 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  32.14 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  27.69 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  33.96 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  26.85 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  39.22 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  35.2 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  34.31 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  34.31 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  34.31 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  34.31 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  36.23 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  34.38 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  36.43 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  28.71 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  36.97 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  43.53 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  32.06 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  29.51 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  32.62 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  32.43 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  32.37 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  34.19 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  33.57 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  33.57 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  33.57 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  39.77 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  37.17 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  26.77 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  33.59 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  32.84 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  36.04 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  26.2 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  26.25 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  36.73 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  33.81 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  32.98 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  32.61 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  30.47 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  25.34 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  34.04 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  30.97 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  31.62 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  34.04 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  30.89 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  37.23 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  36.61 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  33.06 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  35.34 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  28.22 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  30.46 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  30.46 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  25.57 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  30.88 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  36.47 
 
 		 287 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  29.3 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  30.25 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  28.72 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  31.76 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  30.77 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0151  hypothetical protein  32.69 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>