96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3315 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  63.9 
 
 
241 aa  322  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  60.91 
 
 
243 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  62.96 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  64.44 
 
 
243 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  55.6 
 
 
274 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  54.47 
 
 
265 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  33.86 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  35.78 
 
 
266 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  34.91 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  35.48 
 
 
234 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  34.53 
 
 
271 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  33.63 
 
 
271 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  34.8 
 
 
268 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  37.31 
 
 
272 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  33.82 
 
 
268 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  33.17 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  36.28 
 
 
278 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  34.15 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  35.38 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  36.04 
 
 
256 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  32 
 
 
263 aa  92.4  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  34.17 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  34.73 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  32.56 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  31.02 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  32.99 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  30.87 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  31.47 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  31.87 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  35.35 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  32.23 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  32.73 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  37.25 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  32.23 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  31.75 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  32.23 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  33.16 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  32.23 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  32.23 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  35.07 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  31.5 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  34.46 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  32.24 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  30.81 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  36.97 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  31.51 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  34.21 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  34.15 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  31.1 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  33.45 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  36.84 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  32.91 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  30.91 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  32.05 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  33.33 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  29.92 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  38.76 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  36.67 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  29.51 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  29.92 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  30.45 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  30.2 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  36.52 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  30.89 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  29.35 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  38.52 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  33.91 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  29.66 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  30.96 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  29.26 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  37.61 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0466  hypothetical protein  33.51 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941633  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  26.48 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  33.54 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  36.27 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  37.89 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  33.33 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0231  histidine kinase  29.87 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0721367  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  29.6 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  31.33 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  28.16 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1577  hypothetical protein  31.25 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  33.77 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  39.78 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  32.92 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  32.3 
 
 
239 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3108  hypothetical protein  32 
 
 
208 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  28.26 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  28.4 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>