126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3109 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  98.33 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  97.5 
 
 		 240 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  86.67 
 
 		 240 aa  427  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  85.83 
 
 		 240 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  85.83 
 
 		 240 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  86.25 
 
 		 240 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  84.17 
 
 		 240 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  83.75 
 
 		 280 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  71.25 
 
 		 240 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  67.08 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  57.79 
 
 		 242 aa  254  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  56.38 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  55.97 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  55.47 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  44.26 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  43.83 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  38.89 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  39.11 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  35.16 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  37.16 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  36.24 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  36.7 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  37.1 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  37.56 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  37.67 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  37.67 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  37.67 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  37.31 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  35.29 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  35.33 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  34.48 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  36.49 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  34.08 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  30.53 
 
 		 273 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  32.61 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  33.2 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  30.58 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  33.49 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  33.04 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  31.28 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  37.2 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  31.06 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  29.8 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  33.7 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  32.68 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  29.52 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  34.63 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  31.5 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  30.12 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  40.83 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  29 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  32.98 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  31.19 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  29.47 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  36 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  31.16 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  34.41 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  28.74 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  33.69 
 
 		 298 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  31.7 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  31.82 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  29.48 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  35.04 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  31.31 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  27.78 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  32.7 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  26.61 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  37.1 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  28.03 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  30.62 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  31.93 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  40.43 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  37.82 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  27.97 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  28.69 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  41.84 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  27.18 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  35.34 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  27.67 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  29.67 
 
 		 281 aa  62  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  32.18 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  31.5 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  25.57 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2540  hypothetical protein  34.65 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  40.4 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  32.96 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  27.44 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  29 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  33.49 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  26.55 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  31.38 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  23.73 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  25.21 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3348  hypothetical protein  29.8 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00245935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  29.33 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>