83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_50070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  98.31 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  58.58 
 
 		 238 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  59.09 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  54.55 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  51.46 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2255  hypothetical protein  52.27 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3520  hypothetical protein  51.82 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3043  putative lipoprotein  50.91 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09830  hypothetical protein  50.42 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  26.29 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  31.73 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  29.28 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  30.11 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  34.53 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  30.71 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  31.5 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  27.62 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  30.71 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  30.71 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  30.71 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  30.17 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  31.5 
 
 		 230 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  29.13 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.13 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.13 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.13 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  28.64 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  26.97 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  26.83 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  25.25 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  28.41 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  26.55 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  35.23 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  25.11 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  26.55 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  28.46 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  29.06 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  28.85 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  33.78 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  29.59 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  27.78 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  28.04 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  27.54 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  27.55 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  34.52 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  27.19 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  25.48 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  31.03 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  25.32 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  38.36 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  27.42 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  37.18 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  24.88 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  28.17 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  31.96 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  30.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  27.12 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  28.99 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  31.01 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  25.97 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  30.3 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  22.75 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  25.89 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  25.24 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  27.74 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  37.18 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  30.7 
 
 		 267 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  30.71 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  29.33 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  31.33 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  30.71 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  24.71 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  26.05 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  28 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3108  hypothetical protein  36.36 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  31.58 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  23.9 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  23.32 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  31.43 
 
 		 260 aa  42  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>