83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4265 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  98.31 
 
 
237 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3788  hypothetical protein  59.5 
 
 
242 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0260042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1444  hypothetical protein  58.16 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1590  hypothetical protein  54.96 
 
 
242 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2407  hypothetical protein  51.88 
 
 
239 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105195  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2255  hypothetical protein  52.73 
 
 
239 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3520  hypothetical protein  52.27 
 
 
239 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3043  putative lipoprotein  51.82 
 
 
239 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09830  hypothetical protein  50 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  26.29 
 
 
252 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  31.25 
 
 
245 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  30.84 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  32.28 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  28.18 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  31.5 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  31.5 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  29.92 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  28.73 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  36.07 
 
 
229 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  30.71 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  26.36 
 
 
240 aa  62  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  31.5 
 
 
230 aa  62  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  30.77 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  27.27 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  25.57 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  29.13 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.13 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.13 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.13 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  25.57 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  25.57 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  27.8 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  26.94 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  35.63 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  26.94 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  28.14 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  25.25 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  27.06 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  29.59 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  28.46 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  29.56 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  26.61 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  33.78 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  28.85 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  28.97 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  34.52 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  27.19 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  25.43 
 
 
263 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  27.69 
 
 
241 aa  52  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  31.03 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  38.36 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  25.95 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  27.7 
 
 
278 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  25.42 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  30.3 
 
 
280 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  24.07 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  26.88 
 
 
272 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  25.71 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  30.83 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  31.58 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  24.52 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  31.01 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  30.3 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  31.75 
 
 
234 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  27.12 
 
 
219 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  26.81 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  31.75 
 
 
239 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  28.65 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  28.86 
 
 
267 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  29.33 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  27.23 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  31.33 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  24.71 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  30.71 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  30.71 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  28 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  27.45 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  22.58 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  25.28 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3108  hypothetical protein  36.04 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  31.58 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>