138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0052 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  44.53 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  48.95 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  40.52 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  43.97 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  42.41 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  43.16 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  41.87 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  42.8 
 
 		 269 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  42.8 
 
 		 271 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  42.86 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  43.59 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  40.8 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  42.49 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  41.63 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  36.57 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  34.96 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  32.91 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  36.1 
 
 		 230 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  35.81 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  35.78 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  30.43 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  36.92 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  31.34 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  32.52 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  34.2 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  33.18 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  31.33 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  37.2 
 
 		 243 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  32.5 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  30.9 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  35.12 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  30.47 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  30.47 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  32.33 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  30.04 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  30.04 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  32.64 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  28.19 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0217  hypothetical protein  36.02 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.207419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  29.54 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  29.96 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  29.96 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  29.96 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  30.29 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  38.31 
 
 		 230 aa  95.5  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  33.03 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  31.53 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3315  hypothetical protein  33.85 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.0899377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  31.53 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  27.73 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  31.53 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  28.96 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  27.07 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  30.15 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  41.67 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  29.84 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  28.91 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  32.59 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  29.25 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  31.1 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  37.33 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  28.68 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  32.74 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1600  hypothetical protein  40.14 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.400677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  28.68 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  38.85 
 
 		 280 aa  85.5  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  29.46 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  32.97 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  30.18 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2403  hypothetical protein  37.29 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  28.16 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1577  hypothetical protein  31.85 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  36.3 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  30.56 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  37.61 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  33.18 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  29.91 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  38.13 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  32.46 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  38.3 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  42.45 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  31.11 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  28.5 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  28.5 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  28.5 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  30.47 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  34.96 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  28.04 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  35.83 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  37.7 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  42.35 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  28.65 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4213  hypothetical protein  28.65 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0128  hypothetical protein  28.65 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  27.78 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>