299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4607 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.86 
 
 		 789 bp  1485    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  96.58 
 
 		 789 bp  1342    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.73 
 
 		 789 bp  1477    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  98.86 
 
 		 789 bp  1485    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4607    100 
 
 		 788 bp  1562    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  94.45 
 
 		 789 bp  1160    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.48 
 
 		 789 bp  1461    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  97.08 
 
 		 789 bp  1374    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.86 
 
 		 789 bp  1485    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  86.41 
 
 		 789 bp  500  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  81.77 
 
 		 837 bp  109  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  80.3 
 
 		 837 bp  85.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  84.07 
 
 		 834 bp  81.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  82.58 
 
 		 843 bp  79.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  82.09 
 
 		 825 bp  75.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  84.16 
 
 		 819 bp  73.8  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3216  ABC transporter related  95.56 
 
 		 1086 bp  73.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  84.38 
 
 		 849 bp  71.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1045  arginine transporter ATP-binding subunit  83.84 
 
 		 729 bp  69.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0995  arginine transporter ATP-binding subunit  83.84 
 
 		 729 bp  69.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.938307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  97.44 
 
 		 792 bp  69.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1026  arginine transporter ATP-binding subunit  83.84 
 
 		 729 bp  69.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0963  arginine transporter ATP-binding subunit  83.84 
 
 		 729 bp  69.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0928  arginine transporter ATP-binding subunit  83.84 
 
 		 729 bp  69.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  95.35 
 
 		 669 bp  69.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5203    95.24 
 
 		 1764 bp  67.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  95.24 
 
 		 750 bp  67.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6377  ABC transporter related  95.24 
 
 		 738 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6610  ABC transporter related  95.24 
 
 		 738 bp  67.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0715405 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  93.48 
 
 		 777 bp  67.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2939  ABC transporter ATP-binding protein  93.33 
 
 		 1077 bp  65.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.878604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  93.33 
 
 		 762 bp  65.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  95.12 
 
 		 750 bp  65.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  93.33 
 
 		 690 bp  65.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6208  ABC transporter related  95.12 
 
 		 738 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  93.33 
 
 		 723 bp  65.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  93.33 
 
 		 786 bp  65.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  93.33 
 
 		 735 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  93.33 
 
 		 735 bp  65.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  93.33 
 
 		 795 bp  65.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  95.12 
 
 		 810 bp  65.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  93.33 
 
 		 726 bp  65.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  93.33 
 
 		 735 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1830  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 765 bp  63.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  93.18 
 
 		 1050 bp  63.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  91.67 
 
 		 840 bp  63.9  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  95 
 
 		 738 bp  63.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  93.18 
 
 		 771 bp  63.9  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  89.29 
 
 		 816 bp  63.9  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  94.87 
 
 		 1149 bp  61.9  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  93.02 
 
 		 765 bp  61.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  80 
 
 		 903 bp  61.9  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  94.87 
 
 		 780 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  94.87 
 
 		 1137 bp  61.9  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  82.24 
 
 		 930 bp  61.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1249  ABC transporter related  94.87 
 
 		 762 bp  61.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.540719  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  91.49 
 
 		 759 bp  61.9  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  94.87 
 
 		 726 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  91.3 
 
 		 1047 bp  60  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  92.86 
 
 		 675 bp  60  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  94.74 
 
 		 1704 bp  60  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  90 
 
 		 834 bp  60  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2913  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  92.86 
 
 		 738 bp  60  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  94.74 
 
 		 738 bp  60  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3567  ABC transporter  94.74 
 
 		 765 bp  60  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0306  ABC glutamate/aspartate transporter, inner membrane subunit GltL  94.74 
 
 		 819 bp  60  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  92.86 
 
 		 810 bp  60  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  92.86 
 
 		 729 bp  60  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  94.74 
 
 		 765 bp  60  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  94.74 
 
 		 750 bp  60  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  91.3 
 
 		 810 bp  60  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  88.89 
 
 		 813 bp  60  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2925  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, ATPase subunit  94.74 
 
 		 828 bp  60  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628075  normal  0.276271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  92.86 
 
 		 735 bp  60  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  92.86 
 
 		 1773 bp  60  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  94.74 
 
 		 1779 bp  60  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  94.74 
 
 		 705 bp  60  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  92.86 
 
 		 708 bp  60  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  91.3 
 
 		 810 bp  60  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  92.86 
 
 		 1053 bp  60  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  94.74 
 
 		 723 bp  60  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3772  ABC transporter related  92.86 
 
 		 765 bp  60  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446959  hitchhiker  0.00629002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  92.86 
 
 		 828 bp  60  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  92.86 
 
 		 759 bp  60  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3189  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  94.74 
 
 		 1095 bp  60  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  92.86 
 
 		 735 bp  60  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  92.68 
 
 		 669 bp  58  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2812  ABC transporter related  92.68 
 
 		 783 bp  58  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.844738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  92.68 
 
 		 726 bp  58  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1434  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  92.68 
 
 		 774 bp  58  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  91.11 
 
 		 837 bp  58  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2600  ABC transporter related  91.11 
 
 		 732 bp  58  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.187243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>