110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0919 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0919  outer membrane porin protein LC  100 
 
 		 175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00124369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  98.18 
 
 		 357 aa  332  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  98.18 
 
 		 357 aa  332  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  58.33 
 
 		 387 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  57.47 
 
 		 360 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  55.29 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  55.29 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  55.29 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  55.29 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  53.33 
 
 		 368 aa  174  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  54.71 
 
 		 363 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00508  hypothetical protein  56.25 
 
 		 170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.387871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  54.6 
 
 		 359 aa  167  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  53.71 
 
 		 369 aa  164  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  55.29 
 
 		 351 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  55.29 
 
 		 351 aa  164  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  55.29 
 
 		 351 aa  164  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  55.29 
 
 		 351 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  55.56 
 
 		 350 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  55.56 
 
 		 350 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  55.56 
 
 		 350 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  55.56 
 
 		 350 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  55.56 
 
 		 350 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  54.44 
 
 		 351 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  55.29 
 
 		 351 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  54.44 
 
 		 351 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1589  outer membrane porin protein LC  55.17 
 
 		 333 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.810656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1776  outer membrane protein N  55.21 
 
 		 372 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  55.11 
 
 		 362 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  55.11 
 
 		 362 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  55.11 
 
 		 362 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  55.11 
 
 		 362 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  53.41 
 
 		 377 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  53.41 
 
 		 377 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  53.41 
 
 		 377 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  53.41 
 
 		 377 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  53.41 
 
 		 377 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  52.84 
 
 		 377 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  51.26 
 
 		 398 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1614  outer membrane protein N  54.49 
 
 		 377 aa  158  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.51983  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  48.99 
 
 		 403 aa  157  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  50.75 
 
 		 398 aa  157  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  50.25 
 
 		 400 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  57.33 
 
 		 345 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  57.33 
 
 		 345 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  52.35 
 
 		 350 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  51.89 
 
 		 383 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  51.89 
 
 		 383 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  53.49 
 
 		 362 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  53.49 
 
 		 362 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  53.49 
 
 		 362 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  53.49 
 
 		 362 aa  153  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  53.49 
 
 		 362 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  53.49 
 
 		 362 aa  153  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  53.49 
 
 		 362 aa  154  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  51.89 
 
 		 383 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  53.49 
 
 		 362 aa  154  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  53.89 
 
 		 357 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  54.27 
 
 		 378 aa  151  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  50.58 
 
 		 366 aa  151  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  50 
 
 		 388 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  51.85 
 
 		 360 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  51.85 
 
 		 360 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  51.6 
 
 		 380 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  52.66 
 
 		 367 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  50.58 
 
 		 366 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  53.09 
 
 		 360 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  54.12 
 
 		 364 aa  147  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  50.28 
 
 		 376 aa  148  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  49.71 
 
 		 373 aa  147  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02142  outer membrane porin protein C  53.25 
 
 		 311 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  53.25 
 
 		 367 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  52.07 
 
 		 368 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02101  hypothetical protein  53.25 
 
 		 329 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  50.28 
 
 		 376 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  52.66 
 
 		 363 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  48.89 
 
 		 360 aa  144  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  50 
 
 		 372 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  51.74 
 
 		 360 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  51.74 
 
 		 360 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  51.74 
 
 		 360 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  49.45 
 
 		 378 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  49.45 
 
 		 378 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  49.45 
 
 		 378 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  49.45 
 
 		 378 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  49.45 
 
 		 378 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  49.12 
 
 		 370 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1637  porin Gram-negative type  45.29 
 
 		 363 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000904946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1636  porin Gram-negative type  43.27 
 
 		 366 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00881116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  43.89 
 
 		 371 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  43.89 
 
 		 371 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  44.25 
 
 		 365 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  43.33 
 
 		 371 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  46.91 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  46.91 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  46.91 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  46.91 
 
 		 372 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  46.01 
 
 		 372 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1245  outer membrane protein N  53.03 
 
 		 132 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.950154  normal  0.879183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1666  porin Gram-negative type  39.56 
 
 		 379 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000017605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>