113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00508 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00508  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.387871  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  88.82 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  76.61 
 
 		 359 aa  269  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  77.71 
 
 		 362 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  77.71 
 
 		 362 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  77.71 
 
 		 362 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  77.71 
 
 		 362 aa  266  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1589  outer membrane porin protein LC  79.65 
 
 		 333 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.810656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  67.06 
 
 		 366 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  67.06 
 
 		 366 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  65.71 
 
 		 368 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  65.14 
 
 		 367 aa  217  7.999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  66.08 
 
 		 363 aa  216  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000192905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  64.44 
 
 		 376 aa  216  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  65.5 
 
 		 367 aa  215  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  63.89 
 
 		 376 aa  215  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  65.19 
 
 		 378 aa  214  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  66.67 
 
 		 364 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02142  outer membrane porin protein C  64.91 
 
 		 311 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02101  hypothetical protein  64.91 
 
 		 329 aa  212  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1776  outer membrane protein N  65.71 
 
 		 372 aa  210  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  64.29 
 
 		 372 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  62.98 
 
 		 380 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1614  outer membrane protein N  62.84 
 
 		 377 aa  208  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.51983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  60.43 
 
 		 387 aa  207  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  62.3 
 
 		 377 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  62.3 
 
 		 377 aa  206  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  62.3 
 
 		 377 aa  206  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  62.3 
 
 		 377 aa  206  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  62.3 
 
 		 377 aa  206  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  64.29 
 
 		 383 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  64.29 
 
 		 383 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  64.29 
 
 		 383 aa  206  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  61.75 
 
 		 377 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  60.99 
 
 		 369 aa  204  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  58.71 
 
 		 403 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  62.7 
 
 		 388 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  61.08 
 
 		 378 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  61.08 
 
 		 378 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  61.08 
 
 		 378 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  61.24 
 
 		 370 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  61.08 
 
 		 378 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  58.67 
 
 		 400 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  61.08 
 
 		 378 aa  200  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  62.21 
 
 		 350 aa  199  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  59.28 
 
 		 398 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  59.28 
 
 		 398 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  58.52 
 
 		 373 aa  191  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.437604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  61.27 
 
 		 351 aa  190  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  61.27 
 
 		 351 aa  190  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  61.27 
 
 		 351 aa  190  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  61.27 
 
 		 351 aa  190  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  58.47 
 
 		 371 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000019147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  58.47 
 
 		 371 aa  189  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  58.47 
 
 		 371 aa  189  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  60.69 
 
 		 351 aa  187  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  60.12 
 
 		 351 aa  187  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  60.12 
 
 		 351 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  56.9 
 
 		 360 aa  182  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000261923  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  56.9 
 
 		 360 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  59.06 
 
 		 357 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  58.72 
 
 		 350 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  58.72 
 
 		 350 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000741681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  58.72 
 
 		 350 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  58.72 
 
 		 350 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  58.72 
 
 		 350 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  58.05 
 
 		 360 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000037634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  54.4 
 
 		 371 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  53.26 
 
 		 368 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  51.7 
 
 		 363 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  51.7 
 
 		 363 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  51.7 
 
 		 363 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  51.7 
 
 		 363 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  60.84 
 
 		 345 aa  178  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  60.84 
 
 		 345 aa  178  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  57.39 
 
 		 362 aa  178  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  51.7 
 
 		 363 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.918744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  57.39 
 
 		 362 aa  177  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000151629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  57.39 
 
 		 362 aa  177  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  57.39 
 
 		 362 aa  177  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  57.39 
 
 		 362 aa  177  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  57.39 
 
 		 362 aa  177  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  57.39 
 
 		 362 aa  176  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000488881  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  53.85 
 
 		 371 aa  176  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  57.39 
 
 		 362 aa  176  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  53.3 
 
 		 371 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  55.31 
 
 		 357 aa  174  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  55.49 
 
 		 360 aa  173  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  55.49 
 
 		 360 aa  173  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  55.49 
 
 		 360 aa  173  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  55.31 
 
 		 357 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0919  outer membrane porin protein LC  56.25 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00124369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  52.97 
 
 		 365 aa  171  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  54.49 
 
 		 360 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  51.45 
 
 		 372 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  51.45 
 
 		 372 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  51.45 
 
 		 372 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  51.45 
 
 		 372 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  51.45 
 
 		 372 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1245  outer membrane protein N  65.65 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.950154  normal  0.879183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>