121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0071 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  98.55 
 
 
1725 bp  3221    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  98.72 
 
 
1725 bp  3245    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  98.55 
 
 
1725 bp  3221    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  99.19 
 
 
1725 bp  3309    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.55 
 
 
1725 bp  3221    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.72 
 
 
1725 bp  3245    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  96.35 
 
 
1815 bp  2920    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0071    100 
 
 
1725 bp  3420    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.86 
 
 
1755 bp  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.74 
 
 
1755 bp  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.28 
 
 
1755 bp  842    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.86 
 
 
1755 bp  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.8 
 
 
1755 bp  914    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  96.52 
 
 
1725 bp  2944    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.28 
 
 
1725 bp  396  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.68 
 
 
1719 bp  256  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.21 
 
 
1722 bp  238  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.11 
 
 
1722 bp  208  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.37 
 
 
1719 bp  184  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  80.71 
 
 
1719 bp  167  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.12 
 
 
1728 bp  141  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.12 
 
 
1782 bp  141  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.12 
 
 
1728 bp  141  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.57 
 
 
1719 bp  131  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  84.62 
 
 
1725 bp  99.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  80.86 
 
 
1719 bp  97.6  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.55 
 
 
1719 bp  89.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  91.94 
 
 
1719 bp  83.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.57 
 
 
1725 bp  83.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  100 
 
 
1764 bp  81.8  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.27 
 
 
1722 bp  81.8  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.55 
 
 
1722 bp  77.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  83.19 
 
 
1722 bp  77.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  85.26 
 
 
1758 bp  77.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.721399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  94 
 
 
1842 bp  75.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.65 
 
 
1764 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  90.32 
 
 
1719 bp  75.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  94 
 
 
1776 bp  75.8  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  94 
 
 
1779 bp  75.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.56 
 
 
1779 bp  73.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  83.33 
 
 
1722 bp  71.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.03 
 
 
1719 bp  71.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.62 
 
 
1779 bp  69.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.48 
 
 
1764 bp  67.9  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.48 
 
 
1764 bp  67.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.48 
 
 
1764 bp  67.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.48 
 
 
1764 bp  67.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2288  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.48 
 
 
1764 bp  67.9  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2181  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  93.48 
 
 
1764 bp  67.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384106  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  83.17 
 
 
1701 bp  65.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  83.17 
 
 
1722 bp  65.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  91.67 
 
 
1779 bp  63.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  91.67 
 
 
1755 bp  63.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.29 
 
 
1719 bp  63.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  90.2 
 
 
1731 bp  61.9  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.74 
 
 
1857 bp  61.9  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  81.51 
 
 
1719 bp  61.9  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  85.14 
 
 
1725 bp  60  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  91.3 
 
 
1749 bp  60  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.86 
 
 
1725 bp  60  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  94.74 
 
 
1692 bp  60  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.65 
 
 
1806 bp  60  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  90 
 
 
1719 bp  60  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  85.14 
 
 
1725 bp  60  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  90 
 
 
1719 bp  60  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4678  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  85.14 
 
 
1725 bp  60  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000775214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42520  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.62 
 
 
1725 bp  60  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.82 
 
 
1722 bp  60  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2261  acetolactate synthase, large subunit  91.11 
 
 
1749 bp  58  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.18 
 
 
1719 bp  58  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  89.8 
 
 
1788 bp  58  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  80 
 
 
1725 bp  56  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  87.5 
 
 
1767 bp  56  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.58 
 
 
1782 bp  56  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  85.29 
 
 
1719 bp  56  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  96.88 
 
 
1863 bp  56  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  87.5 
 
 
1701 bp  56  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0087  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
522 bp  56  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  96.88 
 
 
1695 bp  56  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
522 bp  56  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  84.51 
 
 
1719 bp  54  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.36 
 
 
1764 bp  54  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  80.67 
 
 
1719 bp  54  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  88.24 
 
 
1725 bp  54  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1319  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  81.31 
 
 
1713 bp  54  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.36 
 
 
1725 bp  54  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.36 
 
 
1764 bp  54  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0754  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.36 
 
 
1725 bp  54  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.36 
 
 
1764 bp  54  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  83.78 
 
 
1758 bp  52  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.13 
 
 
1764 bp  52  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.13 
 
 
1764 bp  52  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  89.13 
 
 
1764 bp  52  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  87.04 
 
 
1725 bp  52  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  92.11 
 
 
1806 bp  52  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  90.48 
 
 
1758 bp  52  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 
1647 bp  52  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 
1647 bp  52  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 
1647 bp  52  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 
1647 bp  52  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>