38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2893 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  68.75 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  27.17 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  26.45 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  27.13 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  27.21 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  26.42 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  51.06 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  25.78 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  27.84 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  53.66 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  53.66 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  29.88 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  30.72 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  53.66 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  25.36 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  51.43 
 
 		 361 aa  53.5  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  25.09 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  31.25 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  57.14 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  30.58 
 
 		 547 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  44.44 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 		 694 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  44.44 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 		 707 aa  48.9  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  26.02 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  44.44 
 
 		 547 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  34.92 
 
 		 1244 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  48.65 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  40 
 
 		 560 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  34.15 
 
 		 501 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  43.24 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  37.14 
 
 		 635 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  41.03 
 
 		 588 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  29.47 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  40.82 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  36.36 
 
 		 417 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>