34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5219 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  70.23 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  67.11 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  52.77 
 
 		 284 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  52.81 
 
 		 306 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  49.34 
 
 		 285 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  50.66 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  30.94 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  31.56 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  28.87 
 
 		 255 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  37.6 
 
 		 273 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  42.02 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  24.66 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  39.66 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  31.58 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  45.1 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  38.57 
 
 		 383 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  37 
 
 		 538 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  33.85 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  42.55 
 
 		 1144 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  42.55 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  47.22 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  43.9 
 
 		 1139 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  35.42 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  41.46 
 
 		 1124 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  40 
 
 		 501 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  30.48 
 
 		 560 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  35.29 
 
 		 694 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  46.15 
 
 		 530 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  35.9 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  46.15 
 
 		 532 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  37.78 
 
 		 707 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  25.58 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  32.43 
 
 		 1244 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>