32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4868 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 		 306 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  57.19 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  57 
 
 		 293 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  53.75 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  53.7 
 
 		 284 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  52.26 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  54.4 
 
 		 306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  29.39 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  29.19 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  47.06 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  37.37 
 
 		 237 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  38.79 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  37.93 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  39.66 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  24.07 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  30 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  41.25 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  42.86 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  40.98 
 
 		 383 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  39.02 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  31.71 
 
 		 368 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  32 
 
 		 451 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  36.11 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2389  MJ0042 family finger-like protein  26.44 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  44.44 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  43.48 
 
 		 1163 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  27.68 
 
 		 1244 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  43.48 
 
 		 1144 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  28.85 
 
 		 248 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  39.02 
 
 		 1124 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>