25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2386 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 368 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  87.23 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  56.76 
 
 		 256 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0731  hypothetical protein  98.25 
 
 		 58 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.350901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  79.49 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  75.68 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  34.9 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  62.16 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  55.26 
 
 		 254 aa  53.5  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  44.44 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  23.87 
 
 		 2449 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  47.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  47.37 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0057  zinc finger-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4341  Zinc finger-domain-containing protein  41.86 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75184  normal  0.874697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  38.18 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  35.38 
 
 		 538 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  42.86 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  32.2 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  45.45 
 
 		 605 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  45.45 
 
 		 610 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  40.54 
 
 		 1244 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  31.71 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  38.46 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  32.61 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>