35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2196 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  447  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  73 
 
 		 237 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  45.6 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  44.8 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  44.26 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  47.19 
 
 		 244 aa  168  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  47.06 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  30.29 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  39.01 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  40.15 
 
 		 298 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  40.16 
 
 		 306 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  42.19 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  42.19 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  39.42 
 
 		 318 aa  81.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  27.87 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  27.98 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  51.92 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  52.78 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2450  Zinc finger-domain-containing protein  41.03 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.24393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  41.86 
 
 		 417 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  42.86 
 
 		 1144 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  43.94 
 
 		 1163 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 324 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2386  Zinc finger-domain-containing protein  38.46 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.814986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0732  hypothetical protein  38.46 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  41.46 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  45.71 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0992  MJ0042 family finger-like protein  40.54 
 
 		 593 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  31.71 
 
 		 1244 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0935  zinc finger/thioredoxin putative  40.54 
 
 		 594 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0995  MJ0042 family finger-like protein  40.54 
 
 		 597 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.688512  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  37.5 
 
 		 383 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  35.9 
 
 		 588 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0030  hypothetical protein  18.48 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3497  Zinc finger/thioredoxin putative  38.89 
 
 		 304 aa  42  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>