33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2373 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  32.03 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1175  hypothetical protein  28.31 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  24.65 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0833  Zinc finger/thioredoxin putative  26.26 
 
 		 293 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0939857  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  25.78 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0942  Zinc finger/thioredoxin putative  25.26 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0666  Zinc finger/thioredoxin putative  26.77 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.248868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0575  hypothetical protein  24.91 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3088  MJ0042 family finger-like protein  28.4 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4868  Zinc finger/thioredoxin putative  28.21 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186444  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2196  Zinc finger-domain-containing protein  28.03 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  26.52 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1155  MJ0042 family finger-like protein  31.05 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.967228  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2862  Zinc finger-domain-containing protein  30 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2982  MJ0042 family finger-like protein  30.7 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  42.5 
 
 		 361 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0713  hypothetical protein  40.48 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  36.25 
 
 		 383 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  51.43 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  52.63 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  38.1 
 
 		 547 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  24.68 
 
 		 1244 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  34.48 
 
 		 332 aa  46.6  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  35.56 
 
 		 248 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  31.03 
 
 		 417 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  36.51 
 
 		 560 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2018  Zinc finger-domain-containing protein  41.3 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3057  MJ0042 family finger-like protein  31.11 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0479  Zinc finger/thioredoxin putative  32.89 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  35 
 
 		 694 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  35 
 
 		 707 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  31.37 
 
 		 501 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>