34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3605 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3605  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 1244 aa  2197    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.188848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  38.98 
 
 		 897 aa  82.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  23.21 
 
 		 1240 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3319  lytic transglycosylase, catalytic  32.65 
 
 		 718 aa  74.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  33.55 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.67 
 
 		 926 aa  72  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  24.79 
 
 		 602 aa  68.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  33.58 
 
 		 575 aa  67.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  31.86 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  30.72 
 
 		 548 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  29.15 
 
 		 630 aa  63.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4585  FtsK/SpoIIIE family protein  35.34 
 
 		 1311 aa  62.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4940  FtsK/SpoIIIE family protein  35.34 
 
 		 1311 aa  62.4  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  27.59 
 
 		 524 aa  62  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0966  collagen adhesin domain-containing protein  36.73 
 
 		 982 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  31.35 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6555  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.13 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  35.15 
 
 		 489 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4807  ftsk/spoiiie family protein  35.82 
 
 		 1284 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  27.8 
 
 		 440 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  27.8 
 
 		 440 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  31.27 
 
 		 570 aa  53.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  33.07 
 
 		 5185 aa  53.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  31.13 
 
 		 991 aa  53.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  35.15 
 
 		 2353 aa  53.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  42.86 
 
 		 635 aa  52  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  23.47 
 
 		 2313 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  33.74 
 
 		 484 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  25.88 
 
 		 501 aa  49.7  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2252  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1022 aa  48.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0647167  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4422  cell division protein  33.33 
 
 		 1338 aa  47.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4086  putative granule-associated protein  46.15 
 
 		 287 aa  47.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00010965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  37.14 
 
 		 694 aa  46.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  37.14 
 
 		 707 aa  46.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>