36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1751 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  100 
 
 		 694 aa  1332    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  85.56 
 
 		 707 aa  1023    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  39.15 
 
 		 560 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  42.39 
 
 		 418 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  32.52 
 
 		 547 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  51.56 
 
 		 501 aa  213  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  40.89 
 
 		 547 aa  138  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  44.35 
 
 		 417 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  35 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  33.33 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  33.61 
 
 		 262 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  29.84 
 
 		 383 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  32.81 
 
 		 248 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  32.28 
 
 		 256 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  32.77 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  26.67 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0935  zinc finger/thioredoxin putative  54.29 
 
 		 594 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 588 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0995  MJ0042 family finger-like protein  54.29 
 
 		 597 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.688512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1839  MJ0042 family finger-like protein  45.71 
 
 		 986 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0213586  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0992  MJ0042 family finger-like protein  54.29 
 
 		 593 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  43.24 
 
 		 532 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  43.24 
 
 		 530 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 324 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  42.86 
 
 		 1139 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  43.24 
 
 		 538 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1812  zinc finger/thioredoxin putative  41.67 
 
 		 531 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0136465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  40 
 
 		 1144 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  40 
 
 		 1163 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5219  MJ0042 family finger-like protein  32.05 
 
 		 298 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  45.71 
 
 		 610 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  28.19 
 
 		 440 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  50 
 
 		 361 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  42.86 
 
 		 254 aa  44.3  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2217  response regulator  45.71 
 
 		 316 aa  44.3  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1596  Zinc finger-domain-containing protein  40 
 
 		 318 aa  43.9  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>