42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0024 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0024  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 547 aa  1073    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0411  MJ0042 family finger-like protein  35.64 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3397  Zinc finger-domain-containing protein  43.75 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000473344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2497  MJ0042 family finger-like protein  42.36 
 
 		 707 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1751  MJ0042 family finger-like protein  42.36 
 
 		 694 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000114935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2710  hypothetical protein  38.82 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1032  Zinc finger/thioredoxin putative  36.02 
 
 		 501 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000300649  hitchhiker  0.0000540788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  38.66 
 
 		 417 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0863  MJ0042 family finger-like protein  32.23 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.305233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1424  Zinc finger-domain-containing protein  36.79 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0877101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  30.83 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2111  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0575068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0472  hypothetical protein  25.14 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0337887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1544  Zinc finger-domain-containing protein  27.57 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1423  Zinc finger-domain-containing protein  28.7 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328628  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1439  MJ0042 family finger-like protein  28.65 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0935  zinc finger/thioredoxin putative  51.35 
 
 		 594 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0976  Zinc finger-domain-containing protein  51.35 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3141  response regulator receiver protein  45.24 
 
 		 324 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0992  MJ0042 family finger-like protein  51.35 
 
 		 593 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1839  MJ0042 family finger-like protein  42.5 
 
 		 986 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0213586  normal  0.108328 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0453  MJ0042 family finger-like protein  35.56 
 
 		 1144 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0454  MJ0042 family finger-like protein  35.56 
 
 		 1163 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.75357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2118  MJ0042 family finger-like protein  42.55 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000277169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2048  MJ0042 family finger-like protein  42.55 
 
 		 532 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3310  zinc finger/thioredoxin putative  43.59 
 
 		 605 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1812  zinc finger/thioredoxin putative  44.44 
 
 		 531 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0136465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2015  Zinc finger-domain-containing protein  44.44 
 
 		 538 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0702  Zinc finger/thioredoxin putative  48.57 
 
 		 294 aa  47.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2217  response regulator  30.86 
 
 		 316 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4341  Zinc finger-domain-containing protein  34.15 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75184  normal  0.874697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0425  zinc finger/thioredoxin putative  35.56 
 
 		 1139 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2373  Zinc finger-domain-containing protein  38.1 
 
 		 297 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  38.1 
 
 		 1124 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4345  MJ0042 family finger-like protein  35 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.861671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3253  hypothetical protein  51.43 
 
 		 361 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4323  MJ0042 family finger-like protein  35 
 
 		 382 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2979  Zinc finger-domain-containing protein  28.99 
 
 		 255 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0278166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3216  Zinc finger-domain-containing protein  41.67 
 
 		 308 aa  44.3  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639596  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4191  zinc finger/thioredoxin putative  35 
 
 		 392 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2893  Zinc finger/thioredoxin putative  45.71 
 
 		 254 aa  43.5  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3390  MJ0042 family finger-like protein  38.46 
 
 		 610 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0666747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>